分子生物学(5)

2019-04-14 17:13

③正调控机理:葡萄糖↑、cAMP↓、葡萄糖↓、cAMP↑ 4.其它问题

①P区、O区与蛋白质的结合:O区-7-+28有对称性、对称中点位于+11 P区-67n-52有一对称区:可能是cAMP-CAP复合物结合位点 ②影响乳糖操纵子的因素

a. I-、O-、Z-在局部二倍体中的排列

b. 真正的诱导物是异构乳糖,如细胞中有能清除它的物质 c. lacI的表达是弱启动子永久合成的,如其获得强启动子

d. lac系统酶很稳定,停止诱导mRNA后,其酶活性需通过分裂次数上升而稀

e. 当几个降解物敏感型启动子同时出现问题时,很可能是cAMP或CAP的合成

基因出现问题

f. 阻遏物与RNA聚合酶谁先占据位点,则谁发挥作用

g. 相对于Z来说,I的合成速度要慢得多,所以将I+Z+导入I-Z-中去时,Z

会先表达 二.色氨酸操纵子

合成代谢型操纵子的一般策略:外界有则关闭,外界无则打开 1、基本结构

P与O区也有很大重叠,O区20bp中的18bp形成反向重叠的对称结构。 2、阻遏系统

辅阻遏蛋白+trp+操纵区→不表达 辅阻遏蛋白+操纵区→不结合、表达

3、弱化系统:+123—+150缺失造成效率上升,如存在时,很多只转录出140bRNA片断

前导区有AUG与UGA→14个aa多肽→前导肽(未提取到)10、11上连继两个trp

组氨酸:7个, 苯丙氨酸7个

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trpL转录后1、2、3、4区,弱化子有终止子结构,正常1-2、3-4、3-4配对形成终止子(茎环+poly(U))

多trp时,tRNA上带trp多,快速通过两个trp,转录出4时,到达2,2-3无法形成

少trp时,tRNA上带trp少,回忆录出4时,在1,2-3配对,3-4无法形成 4.弱化与阻遏的关系

①可能是粗调与微调的关系,另可能阻遏物的空间结构转变慢 ②当外界有大量trP时,防止140b前导RNA合成,防止浪费 三.原核生物的SOS修复系统 1.SOS机制的RecA、LexA

①SOS修复机制的特点:放松DNA聚合过程中的校正活性,并启动一些修复机制表达 ②RecA与LexA

RecA:在正常重组中起重要作用 a. 重组活性

b. 单链DNA结合活性 c. 蛋白酶活性(需单链DNA)

RecA以依赖单链DNA的蛋白酶活性,作用于极少数蛋白,其中有LexA 有人认为是LexA具有潜在的蛋白酶活性,在RecA的诱导下激活,自体催化裂解

a. 当DNA受重伤时,RecA↑、LexA也拼命合成

(1200分子/C,上升50倍)

b. DNA完好时LexA↑关闭 ③噬菌体的阻遏蛋白 噬菌体的适应性反应 四.魔斑核苷酸水平的调控

大肠杆菌营养缺陷(trp-his-)在缺少任何一种必须氨基酸的培养基上,不仅

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蛋白质合成速度立即下降,RNA合成速度也下降,称为严密控制(基因型rel+)而另一种突变型则RNA合成速度不变,称成松散控制(rel-),rel+可合成鸟苷四磷酸(PPGPP),鸟苷五磷酸(PPPGPP)rel-则不能合成,因为这两种化合物是在层析谱上检出的斑点,称为魔斑。(GTP+ATP→PPPGPP+AMP→PPGPP)rel+的初始信号是空载tRNA比例的上升,由于将AA-tRNA转运到正在延伸的多肽链上需GTP,也许是大量GTP的积累启动了魔斑合成。PPGPP是多效的,但它是主要作用可能是影响RNA聚合酶与启动子结合的专一性,从而成为严密控制的关键。 SD序列的微小变化,可使表达效率上百倍甚至上千倍改变 SD与AUG之间相距一般以4-10个b为佳,9个b最佳。

第七章 真核生物基因组结构及其基因表达调控

一.真核生物基因的重复序列 1.轻度重复序列

2-10个拷贝,中度重复序列10-几百个,高度重复序列(卫星DAN) 2.卫星DNA的等级结构及起源进化

小鼠卫星DNA234→117(有22个不同)→58bp(4个58bp的差异达40%)→(α亚单位)30bp(β亚单位)→三种9个相似重复单位 3?9(原本相同)→27→58→116 不均等交换: XababababY XabababXababY XababababY

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XababXabababY 二.真核生物的基因表达调控 1.顺式作用元件 ①启动子 ②增强子:

首先发现在SV40病毒中,在真核细胞中可能是通过启动子来增强转录的一种远端调控元件,在真核细胞中一般跨度为100-200bp,其核心常由8-12bp,可以有完整或部分的回文结构,常有数个8-12序列 特征:a.作用于同一条链DNA上 b. 无基因特异

c.许多有细胞或组织特异性 d.可在基因外或基因内 e. 无方向性

f. 可远离转录起始位点,常在1-4kb,多达30kb处 作用机制: a.影响模板附近DNA双螺旋结构 b.帮助RNA聚合酶寻找启动子

c. 增强子区可作为反式作用因子或RNA聚合酶Ⅱ进入染色质结构

的入口。

③沉默子 ④绝缘子

效应无件:位于一组基因前端使该组基因应答同一转录调控因子的DNA序列。 热效应元件(HSE)、血清效应元件(SRE)、糖皮质激素效应元件(GRE) 2.反式作用因子

①类固醇受体:与特定类固醇结合而得到激活 ②锌指结构: Cys2/His2 Cys2/Cys2

锌指本身约23个aa 经常是锌指连锌指

③螺旋-转角-螺旋:(H-T-H)

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这一类蛋白质中至少有2个α螺旋,中间由短侧链aa形成“转折” ④螺旋-环-螺旋:

每种两螺旋一侧有疏水残基表面,另一侧有带电基团形成的亲水表面:二聚体的任何一个无碱性区均缺乏与DNA结合的能力

⑤亮氨酸拉链: 每隔6个aa后出现一个亮aa二聚体

⑥同源域蛋白:同源域指编码60个保守aa序列的DNA片断,可能与有机体

的生长、发育和分化密切有关。

3.金属硫蛋白基因的多重调控(P284) BLE(基础水平元件,组成型表达)

TRE(组成型表达及应答,佛波酯试剂信号)

MRE(负责应答金属):重金属中毒时表达,与金属结合再排出体外 GRE(应答类固醇信号):糖皮质激素

第八章 实验技术简介 (详见多媒体课件)

一.限制性核酸内切酶(分子遗传P151) 1.限制-修饰现象:

K B C 2.限制修饰系统: ①Ⅰ:EcoK与EcoB为代表

K 1 10?4B 10?4C 1010?4 1 1 ?41 1 25


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