PCR实验室试剂质检标准操作程序 发布部门:XXXXXX医院检验科 分发范围: 检验科PCR室 编写者: XXX
1.目的:保证每批用于临床实验的试剂的质量良好,符合要求。 2.适用范围:各种用于临床实验的核酸扩增荧光检测试剂。 3.负责人:XXXX 4.程序:
4.1 收到试剂后,目测试剂是否处在冻存状态。
4.2 核对试剂品种和数量并检查包装:外包装(厂名厂址、批准文号、批号和有效期等);内包装
(试剂瓶完整性、试剂配备品种完整性、使用说明书有否等)。
4.3 及时将试剂转入-20℃冰箱保存。将上述检测核对情况在记录表上登记。
4.4 最迟在前批次试剂存量尚可维持常规实验一周时,按如下要求对新批号试剂进行效验实验。 4.5 效验实验:
4.5.1 要求设置:空白对照、阴性对照、阳性对照、室内质控各一,阳性标准品梯度(104、105、106、107)。
4.5.2 出现如下情况中任何一种的,判断为试剂不合格,不能用于临床检测:
a)空白对照出现扩增。如扩增曲线CT值大于25,需重复实验确证试剂污染。
b)阳性对照和阳性标准品均未检出,或阳性对照未检出而阳性标准品检出率大幅下降,表示试剂失效或检测灵敏度大幅下降。
4.5.3 阳性对照未检出,阳性标准品检测正常,提示样品提取液可能存在问题。重复新旧提取液阳性对照实验,确定提取液失效问题。更换提取液后该批试剂方可使用。
4.5.4 空白对照无扩增,阴性对照有扩增,排除其他污染可能性后,提取液存在污染可能。单独用提取液点样上机,出现扩增,需更换提取液后方可使用该批试剂。
4.5.5 阳性对照检出,阳性标准品未检出或扩增曲线明显系统性CT值偏大5个循环以上。提示阳性标准品存在问题。更换阳性标准品后该批试剂方可投入使用。
4.5.6空白对照、阴性对照无扩增,阳性对照正常检出,阳性标准品导出的标准曲线之斜率(-2.9~-3.9)、截距(26~34)、相关性(﹤-0.99)均在使用范围内,表明该批试剂良好,可以投入
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审核者:XXX 批准者:XXX 文件编号:PCR(N)-SOP-007 版本/修订号: A/0 实施日期: 2012年5月1日
临床使用。
4.6 将实验结果归入记录。 6 相关表格
试剂入库使用记录表,编号PCR(N)-SOP-007-01。 试剂质检记录表,编号PCR(N)-SOP-007-02。
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乙型肝炎病毒核酸定量检测标准操作程序 发布部门:XXXXX医院检验科 分发范围: 检验科PCR室 编写者: XXX 审核者:XXX 批准者:XXX 文件编号:PCR(N)-SOP-101 版本/修订号: A/0 实施日期: 2012年5月1日 7 项目名称
乙型肝炎病毒核酸定量检测
8 检验方法名称
TaqMan荧光定量检测
9 方法学原理
PCR扩增时加入一对乙型肝炎病毒DNA特异性引物,同时加入一个特异性的、能与PCR产物杂交的荧光探针,该探针为一寡核苷酸,两端分别标记一个荧光报告基团(R)和一个荧光淬灭基团(Q)。探针完整时,R基团发射的荧光信号被Q基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5’-3’外切酶活性将探针酶切降解,使R荧光基团和Q荧光基团分离,Q基团对R基团的抑制吸收作用消失,荧光监测系统就可接收到R基团的荧光信号。每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成。被切割产生的荧光分子数与PCR产物的数量成比例,这样就实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。因此根据PCR反应液的荧光强度即可计算出初始模板的数量。
10 标本要求
10.1 血清:用一次性无菌注射器抽取受检者静脉血2毫升,注入无抗凝剂普通试管,待凝固后1500r/min离心5分钟,吸取上层血清,转移至1.5ml灭菌离心管;
10.2 血浆:用一次性无菌注射器抽取受检者静脉血2毫升,注入EDTA或枸橼酸钠抗凝剂的试管,轻轻颠倒混匀5~10次,使抗凝剂与静脉充分混匀,5~10分钟后即可分离出血浆,转移至1.5ml灭菌离心管;
10.3 标本保存:标本可立即用于测试,也可以保存于-20℃待测,保存期为6个月。
11 试剂
11.1 试剂名称:乙型肝炎病毒核酸定量检测试剂盒(PCR-荧光探针法) 11.2 生产厂家:中山大学达安基因股份有限公司; 11.3 试剂货号:#DA-B051; 11.4 包装规格:20人份/盒; 11.5 试剂成份: 组成部分 DNA浓缩液(2000μl/管) DNA提取液(500μl/管) HBV PCR反应液(400μl/管) Taq酶(60μl/管) HBV临界阳性质控品(200μl/管) 数量 1管 2管 2管 1管 1管 主要组成成份 PEG6000、NaCl NaOH、Tris-HCl、(PH8.0)、TritonX-100、NP-40、Chelex-100、EDTA(PH8.0) PCR反应缓冲液、上下游引物、荧光探针 Taq酶原液、dNTPs 灭活的HBV阳性血清(1×104IU/ml) 第 11 页/共 93 页
组成部分 HBV强阳性质控品(200μl/管) 阴性质控品(250μl/管) 数量 1管 1管 主要组成成份 灭活的HBV阳性血清(1×107IU/ml) HBV阴性血清 含有HBV扩展目的基因片断的重组质粒(1.0×104IU/ml) 含有HBV扩展目的基因片断的重组质粒(1.0×105IU/ml) 含有HBV扩展目的基因片断的重组质粒(1.0×106IU/ml) 含有HBV扩展目的基因片断的重组质粒(1.0×107IU/ml) HBV阳性定量参考品(1.0×104IU/ml)10μl/管 1管 紫色 HBV阳性定量参考品(1.0×105IU/ml)10μl/管 1管 黄色 HBV阳性定量参考品(1.0×106IU/ml)10μl/管 1管 蓝色 HBV阳性定量参考品(1.0×107IU/ml)10μl/管 1管 绿色 11.6 试剂储存条件:保存于—20℃,有效期6个月。
12 仪器
ABI 7500全自动基因扩增检测仪
13 操作步骤
13.1 DNA提取
13.1.1 标本处理(血清和血浆标本处理相同,在样本处理区操作) 13.1.1.1 取100μl血清加入等量DNA,振荡器振荡混匀5秒; 13.1.1.2 12000r/min离心10min;
13.1.1.3 去上清,沉淀中加入30μl DNA提取液,振荡器剧烈振荡混匀5~10秒,瞬时离心数秒,100℃恒温处理10±1分钟;
13.1.1.4 12000r/min离心5min,备用。 13.1.2 阴性质控品处理
取出阴性质控品,8000rpm离心数秒,吸50μl至0.5ml灭菌离心管中,加入50μl DNA提取液充分混匀,100℃恒温处理10±1分钟;12000r/min离心5min,备用。
13.1.3 HBV临界阳性质控品处理(同阴性质控品); 13.1.4 HBV强阳性质控品处理(同阴性质控品);
13.1.5 HBV阳性定量参考品处理:8000rpm离心数秒,备用; 13.2 PCR扩增
13.2.1 试剂准备(在试剂准备区操作):按比例(HBV PCR反应液40μl/人份+ Taq酶3μl/人份)取相应量的PCR反应液及Taq酶,充分混匀后按43μl/管分装至0.2ml离心管中备用。
13.2.2 加样:向准备好试剂的0.2ml离心管中,分别加入处理后的样品(包括样本、阴性质控品、临界阳性质控品和强阳性质控品)上清液2μl,或直接加入阳性定量参考品2μl,8000rpm离心数秒,放入仪器样品槽。
13.2.3 设置PCR循环扩增程序如下
93℃ 2分钟 预变性;
93℃ 45秒 → 55℃ 60秒 10个循环 93℃ 30秒 → 55℃ 45秒 30个循环
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14 结果判断:
14.1.1 在Results/Amplification 页面查看反应曲线,分析结果时,基线(baseline)取为12-18个循环的荧光信号,此时的阈值(threshold)约为400。
14.1.2 4管阳性标准管、临界阳性对照管的荧光强度对应反应循环数曲线(ΔRn vs. Cycle)应呈较典型的S型曲线,阴性对照管则无此特征,否则实验视为无效。
14.1.3 根据预先输入的5个阳性参考品浓度,仪器自动以阳性参考品基因拷贝浓度的对数值为横坐标,以其实际测得的Ct值为纵坐标,作标准曲线,相关系数应大于等于0.990,否则应视为实验无效。
14.1.4 定量结果分析:质控、标准曲线均满足要求时,可对样品进行定量分析。分析数据时,根据标准曲线自动计算未知标本的相应基因拷贝浓度。
14.1.5 如果增长曲线不呈S型或Ct值=30,则判样品的HBV DNA总含量小于检测极限。 14.1.6 如果增长曲线呈S型曲线且Ct值<30,则按以下方法判断: a ) 若定量数值在线性范围内:1.00E+002≤C≤1.00E+008,则样品HBV DNA总含量为C IU/ml; b ) 如果定量数值在线性范围外,有两种情况:
i. C>1.00E+008,则样品HBV DNA总含量>1.0×108 IU/ml。如果需要精确定量结果,
可将提取后的样品稀释至线性范围内再检测; ii. C<1.00E+002,则样品的HBV DNA总量为C IU/ml,定量数值供参考。
15 质控
a ) 阴性质控品:增长曲线不呈S型曲线或Ct值=30; b ) 阳性质控品:增长曲线呈S型曲线,且强阳性质控品定量参考值在1.0×106IU/ml~2.0×
107IU/ml范围,临界阳性质控品定量参考值在2.0×102IU/ml~2.0×104IU/ml范围;(参考值为仪器自动分析计算出的数值); c ) 阳性定量参考品:全部阳性,且线性相关系数0.97≤|r|≤1; d ) 以上要求需在同一次实验中同时满足,否则,本次实验无效,需重新进行。
16 参考范围
低于检测下限
17 性能指标
检测限:1.0×102IU/ml
线性范围:1.0×102IU/ml~1.0×108IU/ml
18 临床意义
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