最终版PCR SOP体系文件(5)

2019-04-21 17:55

18.1 观察抗病毒药物疗效,指导用药

血循环中HBV DNA水平与HBV感染者病情和预后的关系密切,尤其是急性和慢性乙型肝炎患者。研究发现HBV DNA一直保持较高水平的急性肝炎患者易慢性化,而HBV复制水平较高的慢性肝炎患者不仅对干扰素治疗的反应性差,而且肝组织炎症反应更明显,病情更重,更易发生肝硬化和肝癌。根据《2000 年拉米夫定临床应用指导意见》,中国慢性乙型肝炎病人治疗的目的主要就是降低血清HBV DNA,诱导HBeAg血清转换,使ALT正常化,改善肝脏组织学病变,改善疾病症状、体征,提高生活质量,降低肝硬化和肝癌的发生率。同时血清的HBV DNA滴度的动态变化还可在临床上对用药的剂量、用药时间以及是否需要联合用药等提供参考。

18.2 器官移植中的作用

肝脏器官移植是目前肝硬化晚期治疗的唯一方法,但有约86%以上既往HBsAg携带者术后HBsAg重新出现。检测HBV DNA 可用于观察免疫受损患者的HBV感染状况。肝移植后乙肝主要是复发,再感染为次要因素。特别是移植前HBV复制水平高者,复发的几率更高。定量检测HBV DNA对肝移植术后的跟踪观测具有较好的临床价值。

18.3 对阻断母婴传播的监测

联合应用高放价免疫球蛋白和乙肝疫苗时有效地阻断母婴传播,但仍有一些婴儿对疫苗呈低反应,检测婴儿血循环中HBV DNA可对此进行监测,分析阻断失败的原因。

19 注意事项

19.1 实验室管理应严格按照PCR基因扩增实验室的管理规范,实验人员必须进行专业培训,实验过程严格分区进行(试剂准备区、标本制备区、扩增和产物分析区),所用消耗品应灭菌后一次性使用,实验操作的每个阶段使用专用的仪器和设备,各区各阶段用品不能交叉使用;

19.2 为试剂和标本制备阶段提供生物安全柜,实验过程中穿工作服,带一次性手套,使用自卸管移液器;

19.3 对每次实验进行质量控制;

19.4 试剂使用前要完全解冻,但应避免反复冻融;

19.5 试剂盒DNA提取液内含不溶于水的物质,取样时需用加样器充分混匀后吸取。如出现因吸头嘴部太细不能吸取或取样后堵塞吸头现象,可先用洁净无污染的剪刀将吸头嘴部剪去一截;

19.6 提取的DNA可于—20℃保存6个月; 19.7 “C”表示样品的浓度或含量;

19.8 标本制备区所用过的吸头请打入盛有消毒剂的容器,并与废弃物一起灭菌后方可丢弃; 19.9 实验完毕用10%次氯酸或75%酒精或紫外灯处理工作台和移液器;

19.10 所有检测样品应视为具有传染性物质,操作和处理均需符合相关法规要求:卫生部《微生物生物医学实验室生物安全通用准则》和《医疗废物管理条例》。

20 参考文献

中华人民共和国卫生部医政司编.全国临床检验操作规程(第三版) .南京:东南大学出版社,2006

乙型肝炎病毒核酸定量检测试剂盒(PCR—荧光探针法)说明书.2009年7月,第一版/0 批准记录 批准人 批准时间 有效期 □1年;□其他: □1年;□其他: 第 14 页/共 93 页

□1年;□其他: □1年;□其他: □1年;□其他: 第 15 页/共 93 页

丙型肝炎病毒核酸检测标准操作程序 发布部门:XXXX医院检验科 分发范围: 检验科PCR室 编写者: XXX 审核者:XXX 批准者:XXX 文件编号:PCR(N)-SOP-102 版本/修订号: A/0 实施日期: 2012年5月1日 1 项目名称

丙型肝炎病毒核酸检测

2 检验方法名称

TaqMan荧光定性检测

3 方法学原理

对丙肝病毒进行逆转录反应生成cDNA,PCR扩增时加入一对丙型肝炎病毒cDNA特异性引物,同时加入一个特异性的、能与PCR产物杂交的荧光探针,该探针为一寡核苷酸,两端分别标记一个荧光报告基团(R)和一个荧光淬灭基团(Q)。探针完整时,R基团发射的荧光信号被Q基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5’-3’外切酶活性将探针酶切降解,使R荧光基团和Q荧光基团分离,Q基团对R基团的抑制吸收作用消失,荧光监测系统就可接收到R基团的荧光信号。每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成。被切割产生的荧光分子数与PCR产物的数量成比例,这样就实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。因此根据PCR反应液的荧光强度即可计算出初始模板的数量。

4 标本要求

4.1 血清:用一次性无菌注射器抽取受检者静脉血2毫升,注入无抗凝剂普通试管,待凝固后1500r/min离心5分钟,吸取上层血清,转移至1.5ml灭菌离心管;

4.2 血浆:用一次性无菌注射器抽取受检者静脉血2毫升,注入EDTA或枸橼酸钠抗凝剂的试管,轻轻颠倒混匀5~10次,使抗凝剂与静脉充分混匀,5~10分钟后即可分离出血浆,转移至1.5ml灭菌离心管;

4.3 标本保存:分离后的血清或血浆在2~8℃条件下保持不应超过72小时;-20℃可保存1个月;要长期保存的,需分装后储存于-70℃。

5 试剂

5.1 试剂名称:丙型肝炎病毒核酸检测试剂盒(PCR-荧光探针法) 5.2 生产厂家:XXXXXXX 5.3 试剂货号:#DA-B070; 5.4 包装规格:10人份/盒; 5.5 试剂成份: 组成部分 RNA提取液A(100μl/管) RNA提取液B(4000μl/管) HCV PCR反应液Ⅰ(180μl/管) 数量 1管 1管 1管 主要组成成份 二氧化硅、DEPC水(pH2.0) GuSCN、Tris-HCl(pH6.4)、EDTA(pH8.0)、Triton-100 引物、dNTPs、5×逆转录缓冲液 第 16 页/共 93 页

组成部分 逆转录酶系(20μl/管) HCV PCR反应液(400μl/管) Taq酶(30μl/管) DEPC H2O(200μl/管) 阴性质控品(250μl/管) HCV临界阳性质控品(200μl/管) HCV强阳性质控品(200μl/管) 数量 1管 1管 1管 1管 1管 1管 1管 主要组成成份 mMLV逆转录酶、RNasin 上下游引物、荧光探针、dNTPs、5×PCR反应缓冲液、双蒸水 Taq酶原液、Tris-HCl(pH8.0)、KCl、EDTA(pH8.0)、DTT、丙三醇 DEPC H2O HCV阴性血清 HCV强阳性血浆(2×107IU/ml)稀释1600倍制成 HCV强阳性血浆(2×107IU/ml)稀释16倍制成 含有HCV扩展目的基因片断的重组质粒(1.0×105IU/ml) 含有HCV扩展目的基因片断的重组质粒(1.0×106IU/ml) 含有HCV扩展目的基因片断的重组质粒(1.0×107IU/ml) 含有HCV扩展目的基因片断的重组质粒(1.0×108IU/ml) HCV阳性定量参考品(1.0×105IU/ml)10μl/管 1管 红色 HCV阳性定量参考品(1.0×106IU/ml)10μl/管 1管 黄色 HCV阳性定量参考品(1.0×107IU/ml)10μl/管 1管 蓝色 HCV阳性定量参考品(1.0×108IU/ml)10μl/管 1管 绿色 5.6 试剂储存条件:保存于—20℃,有效期6个月。

6 仪器

ABI 7500全自动基因扩增检测仪

7 操作步骤

7.1 RNA提取

7.1.1 阴性质控品处理

7.1.1.1 取出阴性质控品,8000rpm离心数秒;

7.1.1.2 取灭菌的0.5ml离心管加入10μlRNA提取液A(充分混匀后吸取),加入100μl阴性质控品,再加入200μlRNA提取液B,振荡混匀,室温放置5分钟,8000rpm离心1分钟,小心吸去上清;

7.1.1.3 加200μlRNA提取液B,充分混匀(用移液器吹打),000rpm离心1分钟,小心吸去上清;

7.1.1.4 加预冷的75%乙醇400μl,充分混匀,8000rpm离心1分钟,小心吸去上清; 7.1.1.5 加预冷的75%乙醇400μl,充分混匀,8000rpm离心1分钟,小心吸去上清; 7.1.1.6 打开管盖,65℃干燥10分钟,盖上管盖待用于逆转录。 7.1.2 标本处理(血清和血浆标本处理相同)

7.1.2.1 取灭菌的1.5ml离心管加入10μl RNA提取液A(充分混匀后吸取),加100μl血清,再加入200μl RNA提取液B,振荡混匀,室温放置5分钟,8000rpm离心1分钟,小心吸去上清;

7.1.2.2 一下步骤同“阴性质控品处理”的7.1.1.3~7.1.1.6. 7.1.3 HCV临界阳性质控品处理(同阴性质控品); 7.1.4 HCV强阳性质控品处理(同阴性质控品);

7.1.5 HCV阳性定量参考品处理:8000rpm离心数秒,备用; 7.2 逆转录

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7.2.1 向干燥后的沉淀管加入18μl PCR反应液Ⅰ打匀,再加逆转录酶系2μl,振荡混匀; 7.2.2 37℃放置45分钟,95℃加热3分钟。8000rpm离心1分钟,待用。 7.3 PCR扩增

7.3.1 试剂准备(在试剂准备区操作):按比例(HCV PCR反应液40μl/人份+ Taq酶3μl/人份)取相应量的PCR反应液及Taq酶,充分混匀后按43μl/管分装至0.2ml离心管中备用。

7.3.2 加样:向准备好试剂的0.2ml离心管中,分别加入逆转录后的样品(包括样本、阴性质控品、临界阳性质控品和强阳性质控品)上清液5μl,或直接加入阳性定量参考品5μl,8000rpm离心数秒,放入仪器样品槽。

7.3.3 设置PCR循环扩增程序如下

93℃ 2分钟 预变性;

93℃ 45秒 → 55℃ 60秒 10个循环 93℃ 30秒 → 55℃ 45秒 30个循环

8 结果判断:

8.1 如果增长曲线不呈S型或Ct值=30,则判样品的HCV RNA总含量小于检测极限。 8.2 如果增长曲线呈S型曲线且Ct值<30,则按以下方法判断: a ) 若样品的C<1.00E+003,则样品HCV RNA总含量<1.0×103 IU/ml。 b ) 若样品的1.00E+003≤C≤1.00E+008,则样品HCV RNA总含量为C IU/ml; c ) 若样品的C>1.00E+008,则样品HCV RNA总含量>1.0×108 IU/ml。如果需要精确定量结果,

可将提取后的样品稀释至线性范围内再检测;

9 质控

a ) 阴性质控品:增长曲线不呈S型曲线或Ct值=30; b ) 阳性质控品:增长曲线呈S型曲线,且强阳性质控品定量参考值在5.0×106IU/ml~5.0×

108IU/ml范围,临界阳性质控品定量参考值在2.0×103IU/ml~5.0×105IU/ml范围;(参考值为仪器自动分析计算出的数值); c ) 阳性定量参考品:增长曲线呈S型曲线,Ct值<27,且线性相关系数0.97≤|r|≤1; d ) 以上要求需在同一次实验中同时满足,否则,本次实验无效,需重新进行。

10 参考范围

低于检测下限

11 性能指标

检测限:1.0×103IU/ml

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