思考题:在进行琼脂糖电泳操作过程中,应注意采取哪些保护措施防止溴乙啶污染?
实验四 从琼脂糖凝胶中回收(PCR 产物)DNA片段
实验目的
了解DNA片段回收的原理,掌握用试剂盒回收DNA的方法。 实验原理
本实验所用的回收试剂盒的原理是在NaI存在的条件下,使含有DNA片段的凝胶融化,使DNA片段吸附于硅胶树脂上。最后用TE缓冲液或灭菌水溶出DNA。 实验仪器、材料与试剂 (一) 仪器
1. 高速台式离心机 2. 微量取液器 (二) 材料
实验二切下的含有回收片段的琼脂糖凝胶
(三) 试剂
除试剂盒所带外,余同实验二。 实验步骤
DNA回收操作流程
1. 样品用琼脂糖凝胶电泳后,将目的DNA片
段切出。
2. 将切下的凝胶块放入1.5 ml的Eppendorf
tube中。
注意:制作琼脂糖凝胶及电泳时,建议使用TAE缓冲液。
3. 向反应管中加入约1.5~3倍凝胶量的NaI
溶液 (通常600 ?l), 55℃加热5~10分钟, 使
凝胶完全融化。
4. 按每20 ?l硅胶树脂结合约1 ?g DNA的比例
加入适量的硅胶树脂后,充分混和,室温放
置20分钟。
注意:在使用硅胶树脂前,一定要将硅胶树脂液充分搅匀。
5. 离心 (5,000×g, 1分钟) 后,除去上清。
注意:此上清液在整个回收过程结束后,确认回收率较高时方可扔掉。如果回收率较低
时,可在此上清液中再次加入硅胶树脂液,重新回收。
6. 在反应管中加入500 ?l洗净用缓冲液, 振荡搅匀后离心 (5,000×g, 1分钟), 除去上清。此操作重复一次。
7. 离心后除净上清液,加入TE缓冲液或灭菌
蒸馏水后搅匀,55℃水浴中放置5分钟。
注意:TE缓冲液或灭菌蒸馏水的添加量为硅胶体积的1倍。
8. 离心 (5,000×g, 1分钟),回收上清液,此上
清液即为回收的DNA溶液。
注意:再重复一次7. 8. 的操作可提高回收率。
9. 琼脂糖凝胶电泳检测定量回收DNA。
思考题:琼脂糖凝胶中回收DNA产物操作过程中应特别注意哪些操作环节?
实验五 DNA片段的连接(向质粒载体中插入外源DNA)
实验目的
了解DNA片段连接的原理,掌握DNA连接的方法。 实验原理
外源DNA与载体分子的连接就是DNA重组,这样重新组合的DNA叫做重组体或重组子。重组的DNA分子是在DNA连接酶的作用下,有Mg2+、ATP存在的连接缓冲系统中,将分别经酶切的载体分子与外源DNA分子进行连接。DNA连接酶有两种:T4噬菌体DNA连接酶和大肠杆菌DNA连接酶。两种DNA连接酶都有将两个带有相同粘性末端的DNA分子连在一起的功能,而且T4噬菌体DNA连接酶还有一种大肠杆菌连接酶没有的特性,即能使两个平末端的双链DNA分子连接起来。但这种连接的效率比粘性末端的连接效率低,一般可提高T4噬菌体DNA连接酶浓度或增加DNA浓度来提高平末端的连接效率。
DNA片段之间的连接主要是在DNA连接酶的作用下,使DNA裂口上核苷酸裸露的3'羟基和5'磷酸之间形成共价结合的磷酸二酯键,使原来断开的DNA裂口连接起来。 实验仪器、材料与试剂 (一)仪器
1. 恒温水浴锅或恒温箱 2. 微量取液器 (二)材料
实验四回收的DNA片段。
(三)试剂
试剂盒所带
实验步骤
1. 含有质粒载体DNA(0.03pmol)及插入片段DNA(0.1~0.3pmol)的DNA溶液(TE
缓冲液或去离子水),总体积为5~10μl。
2. 加入与DNA溶液等量的Solution I(5~10μl)混合均匀,﹛Solution I溶液中含
有连接酶和酶反应缓冲液﹜。
3. 16℃连接反应30min(通常连接过夜效果较好)。 4. 当直接进行转化时,取上述连接反应液10~20μl
*3
*1
*2
转化至100μl的感受态细胞。
*1 如果反应温度升高(>26℃),较难形成环状DNA。因此反应必须于16℃进行。 *2 当连接反应难以进行时,可以适当延长反应时间。当连接效率仍然无所改变时,应
当对DNA进行精制后再反应。
*3 连接反应液可以直接用于转化,如发现转化效率偏低时,反应结束后向反应液中添
加NaCl使其终浓度为500mM,然后进行转化,可改善转化效率。
另外,当转化DNA量较大或者利用电刺激转化时,先用乙醇沉淀法精制DNA。
操作流程图
载体DNA (脱磷酸化) 外源DNA片段(磷酸化) DNA 溶液(5~10??l) 开始反应 ×1 体积 溶液Ⅰ(5~10??l) 转 化
实验六 大肠杆菌感受态的制备(CaCl2法)及活性检测
实验目的
学习CaCl2法制备大肠杆菌感受态细胞。 实验原理
用于感受态细胞制备的大肠杆菌菌株一般是限制-修饰系统缺陷的变异株,即不含限制性内切酶和甲基化酶的突变株。受体细胞经过一些特殊方法(如:电击法,CaCl2等化学试剂法)处理后,细胞膜的通透性发生变化,成为能容许带有外源DNA的载体分子进入的感受态细胞。
实验仪器、材料与试剂 (一)仪器
1. 恒温摇床 2. 超净工作台 3. 高压灭菌锅 4. 低温离心机 5. 微量取液器 (二)材料
大肠杆菌DH5α。 (三)试剂
1. LB液体培养基(1升/组) 胰蛋白胨 10 g 酵母提取物 5 g NaCl 10 g 加去离子水至800ml
搅拌,使溶质完全溶解,用NaOH调节pH值至7.0,加入去离子水至总体积为1升,高压蒸汽灭菌20分钟。 LB固体培养基(1升/组)
在上述LB液体培养基(1升)中加入琼脂粉15g。 2. 0.1mol/L CaCl2溶液,高压蒸汽灭菌。