非细胞型
2.细菌的分类
如：病毒、亚病毒、朊粒 细菌的分类是根据一定原则对细菌进行分群归类，并根据相似性与相关性的不同水平排列成系统。
分类原则：细菌表型特征的相似性和系统发育的相关性 细菌的分类单元及其等级：
界(kingdom)、门(phylum)、纲(class)、目(orfer)、科(family)、属(genus)、种(species) 最重要、最基本的单位是种，其次是属，种和属在细菌分类中常用；科及科以上的划分在细菌学中不太完善。
·属(genus)：具有共性的若干种的组合，应与其他属有明显的差异
·种(species)：细菌分类的基本单位。生物学性状基本相同的细菌群体构成一个菌种 ·菌株(strain)：从自然界中分离得到的任何一种微生物的纯培养物都可以称为微生物的一个菌株；对不同来源的同一种细菌称为该菌的不同菌株。同一种细菌可有许多菌株，其主要性状应该完全相同，次要性状可稍有差异，通常用地名或动物名的缩写加编号作菌株名。 标准菌株(type culture strain)：亦称模式菌株，是具有某种细菌典型特征的菌株。 （由于细菌分类单元的划分缺乏一个易于操作的统一标准，为了减少因采用不同标准界定分类单元所造成的混乱，细菌系统分类也像其他生物分类一样采用“模式概念”。） ·培养物(culture)：一定时间、一定空间内微生物的细胞群或生长物。如微生物的鞋面培养物、摇瓶培养物等。
·型(form/type)：常指亚种以下的细分。当同种或同亚种不同菌株之间性状差异，不足以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。如不同的血清型、噬菌型等。
菌株与型的区别：菌株之间不存在鉴别性特征的差异，命名不同的菌株无需分类学依据；不同型的细菌之间存在鉴别性特征的差异，命名或鉴定不同的型必须有分类学依据。
3.细菌的命名
《国际细菌命名法规》：以“拉丁名称字义命名”的原则，根据双名法：属名+种名+命名人 注：属名的第一个字母必须大写，其余均应小写。整个属名及种名在出版物中应排成斜体。 例：Streptococcus mutans Clarke 1924 几种不同的书写情况：
·属名重复出现，可缩写：E.coli（大肠杆菌）
·只确定属名，未确定种名的某一株细菌：Salmonella sp. ·只确定属名，未确定种名的若干株细菌：Salmonella spp. ·亚种用spp.表示
二、细菌的鉴定
细菌鉴定是指借助于现有的细菌分类系统，通过特征测定，确定未知的、新发现的或未明确分类地位的细菌所应归属分类群的过程。 细菌的分类鉴定：
一般只有纯培养的细菌才能进行鉴定。DNA分子水平的鉴定主要限于专业实验室或做研究之用。常用的鉴别方式有染色鉴定、细胞形态鉴定、生理生化鉴定、血清型鉴定、菌细胞组分分析、遗传与分子生物学鉴定等。
分类依据 细胞形态
举例 外形、革兰氏染色、鞭毛、芽孢、大小、排列方式等 - 6 -
菌落形态 生理特性 发酵碳水化合物 水解氨基酸 酵解产物类型 预制酶 抗原 脂类 DNA 酶 肽聚糖 噬菌体分型
三、口腔微生物种群
颜色、溶血、外形、大小等 好氧、厌氧、光合、选择性培养基上生长 产酸或产气 产氨 丁酸盐、乳酸盐、醋酸盐 糖苷酶 对细菌表面蛋白的单克隆或多克隆抗体 甲基萘醌类、长链脂肪酸 碱基构成（G+C比例）、16S rRNA序列 有/无，电泳迁移率 氨基酸组成 哪种噬菌体侵染细菌 口腔微生物的特点：数量多、种类复杂、相互关系密切，细菌是最常见的口腔微生物。 细菌(bacteria)：
按革兰氏染色性质：G+菌、G-菌
按形态分为：球菌、杆菌、弯曲杆菌和螺旋体
按氧耐受性分为：需氧菌、兼性厌氧菌、微需氧菌、专性厌氧菌
古细菌(archaea)：生存在极端环境下（高温、高盐、低pH），细胞壁无肽聚糖 真菌(fungus)
病毒(virus)、支原体(mycoplasma)、原虫(protozoa)、衣原体(chlamydia)等
口腔不同部位常见微生物的分布 部位 唾液 唇 颊 腭 舌 牙 优势微生物 唾液链球菌、缓症链球菌、奈瑟球菌、韦荣球菌、乳杆菌、放线菌 表皮葡萄球菌、口腔链球菌 缓症链球菌 口腔链球菌群、嗜血菌 唾液链球菌、口腔链球菌群、奈瑟球菌 口腔链球菌群、放线菌、梭杆菌、普雷沃菌、卟啉单胞菌、二氧化碳噬纤维菌 牙龈及龈沟 口腔链球菌群、放线菌、梭杆菌、普雷沃菌、卟啉单胞菌、二氧化碳噬纤维菌、韦荣球菌、螺旋体 义齿及矫正器
1.革兰阳性球菌 1.1.兼性厌氧菌
·葡萄球菌属(Staphylococcus)
金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)：革兰阳性球菌，葡萄状排列，β溶血环；触酶阳性，有致病性（凝固酶阳性和甘露醇发酵阳性）；是颌面部疖痈、伤口感染和婴幼儿口角炎的病原菌；
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口腔链球菌群、假丝酵母菌
表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)：常参与牙周、根管或颌面部混合菌感染，是口腔最常见的葡萄球菌，在牙周炎、感染根管、冠周炎等病灶中可检出； 腐生葡萄球菌 解糖葡萄球菌 性状 菌落色素 凝固酶 葡萄糖 甘露醇 α-溶血素 耐热核酸酶 A蛋白 磷壁酸类型 噬菌体分类 致病性 金黄色葡萄球菌 金黄色 + + + + + + 核糖醇型 多数能 强 表皮葡萄球菌 白色 - + - - - - 甘油型 不能 弱
·链球菌属(Streptococcus)
口腔链球菌属是正常口腔中的优势菌群，检出率>80%，是口腔数量和种类最多的革兰阳性的兼性厌氧球菌。
·唾液链球菌群(Saliva streptococcus groups)：唾液链球菌、前庭链球菌
唾液链球菌：①主要从人和动物的口腔中检出，是舌面和唾液中的正常菌群成分，不被认为是机会致病菌；②可产生类细菌素抑制性物质(BLIS)；
·缓症链球菌群(Mitis streptococcus groups)：血液链球菌、口腔链球菌、缓症链球菌
血液链球菌：①球形或卵圆形，直径0.8~1.2μm；②是牙菌斑的主要菌群成分；③可产生对氨基苯甲酸(PABA)，被认为是变异链球菌定植生长的助生菌；④可产生H2O2、血链素等抗菌物质，也被认为是口腔重要的生理菌和牙周益生菌；⑤是条件致病菌，当拔牙或摘除扁桃体时，细菌可以侵入血液，可能导致心内膜炎或败血症。
·变异链球菌群(Mutans streptococcus groups)：变异链球菌、表兄链球菌；表型相同，但血清型和遗传型不同。
变异链球菌：①是主要致龋菌：有强粘附力，产酸耐酸，葡萄糖基转移酶(GTF)；②主要定植在人口腔的非脱落表面（牙面、义齿表面），是龋病的主要病原菌，可导致菌血症、心内膜炎等继发性感染。
·肠球菌属(Enterococcus) ·口腔球菌属(Stomatococcus) ·颗粒链球菌属(Granulicatella) ·孪生球菌属(Gemella)
1.2.革兰阳性厌氧球菌
·消化链球菌属(Peptostreptococcus)
微小消化链球菌：①条件致病菌，常参与口腔内的混合菌感染；牙周炎的主要龈沟菌群成员之一，被视为破坏性牙周炎的主要可疑病原菌之一；③该菌亦可以从口腔其他混合菌感染，以及健康口腔的龈沟和龈上菌斑中检测出。 ·肠球菌属(Enterococcus)
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粪肠球菌：①人体的上呼吸道、口腔或肠道的常驻菌；②根管治疗后继发感染的主要病原菌之一，检出率约80%；③可在根管壁及根尖孔外形成生物膜。 ·消化球菌属(Peptococcus) ·解糖葡萄球菌
2.革兰阳性无芽孢厌氧杆菌 ·放线菌属(Actinomyces)
生物学特性：G杆菌；口腔正常菌群成员，是邻面牙菌斑的主要成分，与根面龋有关。 常见菌种：
黏液放线菌：主要定植与龈下菌斑、龈缘菌斑和牙石，是致龋菌之一。 衣氏放线菌：机会致病菌，可导致颌面部及其他部位放线菌病。 内氏放线菌：主要定植与口腔扁桃体和牙菌斑。 溶牙放线菌
·真杆菌属(Eubacterium) 又名优杆菌属 生物学特性：G+杆菌，无芽孢，专性厌氧杆菌 常见菌种：
迟缓真杆菌：主要定植于肠道。
砂真杆菌、不解乳真杆菌：正常口腔中检出率较高的真杆菌，主要从牙周袋和脓肿中检出；不解乳真杆菌为条件致病菌。
短真杆菌、缠结真杆菌：可疑牙周致病菌。 ·丙酸杆菌属(Propionibacterium)
·乳杆菌属(Lactobacillus)
生物学特性：G+杆菌，厌氧或微需氧，无芽孢杆菌；是人和动物肠道中最常见和最重要的正常菌群成员，对维护健康有重要意义。 常见菌种：
干酪乳杆菌：经常从龋损部位检出，被视为致龋菌。也作为调节人体肠道的益生菌。 嗜酸乳杆菌、发酵乳杆菌 ·双歧杆菌属(Bifidobacterium)
3.革兰阴性球菌 3.1.革兰阴性厌氧球菌 ·韦荣菌属(Veillonella)
生物学特性：G-球菌，厌氧，直径0.3~0.5μm 常见菌种：
小韦荣菌：可从唾液、舌面、牙菌斑等标本中检出，可利用乳酸产生较弱的丙酸，被认为是牙菌斑中的有益菌，也是肠道正常菌群之一。 3.2.革兰阴性需氧和兼性厌氧的球菌
·奈瑟球菌属(Neisseria)
生物学特性：G-菌，需氧，双球菌；是牙面的早期定植菌之一，通过在牙菌斑中消耗氧气为其他厌氧细菌提供生长条件，在牙菌斑的形成中起重要作用；大多数属于正常菌群成员，一般无致病性。
常见菌种：干燥奈瑟菌、乳糖奈瑟菌、微黄奈瑟菌、灰色奈瑟菌、长奈瑟菌 ·黏膜炎莫拉菌(Moraxella catarrhalis)
生物学特性：形态学类似奈瑟球菌属，也叫卡他奈瑟球菌，但该菌与奈瑟球菌的DNA碱
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基组成含量及脂肪酸组成有差异；是脑膜炎、心内膜炎、中耳炎和上颌窦炎的机会致病菌。
4.革兰阴性杆菌 4.1.兼性厌氧菌
·嗜血菌属(Hemophilus) 生物学特性：G兼性厌氧杆菌 常见菌种：
副流感嗜血菌：一般不致病，但可作为条件致病菌。 嗜沫嗜血菌、副溶血嗜血菌 ·二氧化碳噬纤维菌属(Capnocytophaga)
生物学特性：G兼性厌氧杆菌，可滑动；是人和灵长动物的正常菌群成员，主要定植于口腔。
常见菌群：牙龈二氧化碳噬纤维菌属，生痰二氧化碳噬纤维菌属 ·艾肯菌属(Eikenella)
生物学性状：G-兼性厌氧杆菌，无芽孢；血琼脂培养基表面可形成侵蚀性和非侵蚀性两种不同的菌落；与牙周病有关。 常见菌种：啮噬艾肯菌 ·弯曲菌属(Campylobacter)
4.2.革兰阴性无芽孢厌氧杆菌 ·卟啉单胞菌属(Porphyromonas)
牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis)：杆状或球杆状，不分解糖类，有菌毛介导黏附；为主要牙周致病菌，也是牙髓根尖周感染致病菌。 ·坦纳菌属(Tannerella) ·普雷沃菌属(Prevotella)
中间普雷沃菌：主要定植于龈沟，可能是妊娠期牙龈炎的主要病原菌。 产黑色素普雷沃菌：分离自龈沟和一些临床标本
·梭杆菌属(Fusobacterium)
- 生物学特性：G长梭杆菌、无芽孢、无动力；可以和大部分的口腔细菌发生共聚，是早期和晚期牙面黏附菌的重要桥梁；是人和动物体内正常菌群的成员，部分可作为条件致病菌。 代表菌种：具核梭杆菌 ·纤毛菌属(Leptorichia)
·月形单胞菌属(Selenomonas)
生物学特性：G-杆菌、活泼动力、专性厌氧菌、弯曲或螺旋形的杆状。 另：产黑色素革兰阴性厌氧杆菌群：
产生黑色素——黑色菌落
恶臭味培养物
代谢酸为丁酸或乙酸
发酵碳水化合物及产生靛基质试验
代表菌种：牙龈卟啉单胞菌、中间普雷沃菌
4.3.革兰阴性芽孢杆菌
需氧芽孢杆菌属：芽孢杆菌属(Bacillus) 厌氧芽孢杆菌属：梭菌属(Clostridium)
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