配为主体、多种分配形式并存的分配制度逐步建立。财税、金融、价格、流通体制等改革不断深化，实现了财税、外贸、外汇、投资等新旧体制的平稳过渡，形成了比较配套的要素市场。先后实施了两次机构改革，完成区级行政区划调整，行政管理体制改革不断深化，事业单位改革有序展开，行政审批大大提速，转变政府职能步伐加快。社会保障制度改革逐步深入，建立健全了职工养老、医疗、失业、工伤、生育保险制度，社会保障工作居全国领先水平。住房制度改革取得重大进展，建立了住房公积金制度。农村综合改革不断深化，农村社会化服务体系不断完善。科技、教育、文化、卫生、体育等社会事业领域和公用事业改革全面推进，教育卫生资源整合取得重大进展。
抓住学习贯彻邓小平同志视察南方重要讲话精神、我国加入世贸组织的机遇，大力实施外向型经济发展战略，全面推进经济特区、保税区、经济技术开发区、台商投资区、出口加工区建设，逐步成为我国利用外资和引进国外先进技术、先进管理经验比较集中的地区之一。中国国际投资贸易洽谈会越办越好，成为我国惟一以促进双向投资为主题的国家级国际性经贸活动，为内地的招商引资发挥了巨大的平台作用，成为国家级的国际交流交往重要窗口。全市吸引外资结构不断优化，利用外资的质量和水平进一步提高，外商投资企业成为经济发展的主要推动力量。厦门港口一体化改革取得重大进展，进出口贸易持续快速增长，成为我国对外贸易的重要口岸。厦漳泉龙城市联盟建设加快推进，闽西
南五市和闽粤赣十三市区域协作不断深化，山海协作、对口帮扶与支援、参与西部大开发都取得了积极成效。成功举办一系列国际性重大文化体育赛事活动，进一步拓展与海外的联谊联络工作，厦门的国际知名度和影响力不断提高。
坚持基础设施建设先行，加快城市基础设施和公共配套设施建设，加快推进新城(新城博客,新城新闻,新城说吧)区建设和旧城改造，建成一批能源、交通、通讯、供水等重要基础设施项目，海港、空港、信息港重大基础设施进一步完善，形成现代化的陆海空立体交通网、先进的信息通讯网和水电设施配套的投资环境，城市生产生活环境更加完善。城市建设加快向岛外拓展，初步形成了以厦门岛为中心，“一环数片、众星拱月”的城市格局。 坚决贯彻中央对台工作方针政策，认真践行特区的历史使命，努力办好海沧、杏林、集美三个台商投资区，积极拓展对台经贸交流与合作。厦门与高雄集装箱试点直航、厦金客运直航、厦门航点两岸包机直航成效显著，顺利开办五年期台胞证办证中心和赴金门旅游业务，成为台湾同胞进出祖国大陆的“黄金通道”，成为推进两岸“三通”的前沿平台和重要基地。成功举办海峡两岸图书交易会、海峡两岸旅游博览会等重大涉台活动，开办厦门卫视、闽南之声广播，全面开展与台湾之间的科技、教育、文化、卫生、体育、宗教、民俗等方面的交流合作，厦门在两岸关系发展中的前沿平台作用进一步得到发挥。
充分利用全国人大八届二次会议赋予的立法权，制定实施一批关系经济社会发展，关系人民群众利益的地方性法规和政府规章，加快推进依法治市进程。各级人大及其常委会依法行使职权，普法、立法和执法监督工作进一步加强，人民政协的政治协商、民主监督和参政议政作用得到充分发挥。爱国统一战线不断发展壮大，民族、宗教、侨务、外事工作不断加强，工会、共青团、妇联等人民团体的桥梁纽带作用得到有效发挥。普法宣传教育全面展开，公民的法律意识和法制观念进一步增强，人民群众的民主权利得到进一步保障。社会事业全面协调发展，精神文明建设深入推进，社会保持安定和谐有序，生态环境建设水平不断提高，先后取得国家卫生城市、国家园林城市、国家环保模范城市、全国科教兴市先进城市、中国人居环境奖、中国优秀旅游城市、全国双拥模范城六连冠、全国文明城市、联合国人居奖等一系列殊荣。
第四阶段是2006年初胡锦涛总书记视察厦门并发表重要讲话以来的现阶段。全市上下以学习贯彻胡锦涛总书记的重要讲话精神为动力，深入贯彻落实科学发展观，进一步解放思想、开拓创新，继续发挥经济特区的“窗口”、“试验田”和“排头兵”作用，深入实施“十一五”规划，又好又快推进新一轮跨越式发展，努力在思想认识、经济发展、社会和谐、城市建设、对台工作等方面实现新跨越。
认真总结厦门改革开放30年取得的经验，坚决破除那些与科学发展不相适应的思想观念、体制机制障碍，增强广大党员干部深入贯彻落实科学发展观的自觉性和坚定性。认真贯彻省委关于建设海峡西岸经济区的重大决策部署和对厦门工作提出的一系列重要要求，主动融入海峡西岸经济区建设大局，进一步完善发展的目标思路和方法举措，持续提升又好又快推进新一轮跨越式发展的宏大气势、强劲态势和良好趋势，努力在海峡西岸建设科学发展的先行区和两岸人民交流合作的先行区中发挥示范榜样和先行先试作用，努力为推进海峡西岸经济区建设和促进祖国统一大业做出历史性的贡献。
坚持以发展为第一要务，以经济建设为中心，以发展现代工业为重点，通过工业的快速发展，壮大第三产业，提升第一产业，促进三次产业在更高层次上协调发展。大力推进火炬（翔安）产业区、同安工业集中区、集美机械工业集中区、软件园二期、环东海域等工业集中区建设和招商引资工作，致力打造海峡西岸强大的先进制造业基地。大力推进自主创新，进一步转变经济发展方式，友达光电、通士达照明、宸鸿电子、富士康光电等一批高新项目落地投产，光电、软件、生物与新医药、新材料等新兴产业集群快速发展壮大，五缘湾、观音山、杏林湾商务营运中心以及环东海域东海科技园的开发建设和招商引资工作快速推进，海沧保税港区以及东渡现代物流区等加快建设，金融、会展、旅游等现代服务业快速发展，三次产业结构在调整优化升级中形成良
性互动，经济发展的速度、结构、质量、效益实现相协调，经济发展的后劲进一步增强。
加快推进以改善民生为重点的和谐厦门建设。紧紧围绕“四个加强”、“四个破解”这一现阶段构建和谐社会的主要任务，相继出台实施了一系列开创性、可操作性的政策措施，进一步加强就业再就业工作、“平安厦门”建设、市政设施建设和城乡基层组织建设，努力破解住房难、就医难、就学难、交通难等群众最关心、最直接、最现实的利益问题。在全国率先推行社会保障性住房建设模式，率先建立城乡一体的全民医保体系，率先实现“双高普九”和实行义务教育阶段城乡居民子女免收学杂费，以及减免农民工子女义务教育收费，各项民生保障工作水平有新的提高。深入开展新一轮全国文明城市创建活动，市民文明素质和城市文明程度进一步提升。大力发展文化事业和文化产业，城市文化软实力日益增强。创造性地实施“金包银”工程和“移民造福”工程，积极推进符合厦门实际的社会主义新农村建设，农民收入明显增加。扎实推进资源节约型、环境友好型城市建设，生态环境和人居环境不断优化，生态文明建设取得历史性进步。
继续推进现代化港口风景旅游城市和海峡西岸重要中心城市建设，科学谋划并大力推进新一轮城市基础设施和一批重大工程建设，主要有环东海域综合整治建设和观音山、五缘湾、湖边水库、杏林湾、厦门火车站（新站）等重大片区开发建设项目，福厦铁路、厦深铁路、龙厦铁路和翔安海底隧道、杏林大桥、集