“钉钉石栏杆”上的浮雕
五代时石狮子浮雕
殿内尚存吴道子绘老子像复刻石碑，碑上有唐玄宗李隆基的御赞和颜真卿的题字，被称为三绝碑。另有“天庆观尚书省到并部符使帖”石碑，两碑均是南宋原物，为国之艺术瑰宝。
吴道子绘老子像复刻石碑
位于散曲三清殿的东，高6.7米、宽2.7米的巨大无字碑。它就是著名的方孝孺无字碑 ，为我国四大无字碑之一。其余三块是泰山登封台无字碑和乾陵武则天无字碑，连同十三陵无字碑 。上面原刻着明代洪武间宰相、建文帝朱允炆的老师、大文学家方孝孺撰写的一篇碑文。记述的是洪武四年（1371）清理道教，称玄妙观为正一丛林，设道纪司，革昆山县五十顷香火田充军晌等史实。字字铁划银钩，不同凡品。后来燕王朱棣篡夺了侄子朱允炆的皇位， 称永乐帝，要方孝孺为他起草诏书。方孝孺誓死不从，结果惨遭杀害，十族同诛。他死之后，朱棣连这块碑上的碑文都不放过，下旨全部铲除，石碑就成了今天的无字碑 。尽管碑文是被朱棣强令铲除的，但是，石碑仍补后人妥为保护，至今巍然独存于玄妙观内。
方孝孺无字碑
运木古井
位于蓑衣真人殿的天井内。1999年玄妙观维修过程中在三清殿前中轴线上发现一座古井，井中出土近30件文物，此古井系五代遗物。井亭上有施起鹏所题“元都第一景”匾额。相传建造弥罗宝阁时，一时木材短缺，经道人布施法术，即有木材从井中源源输出，保证了工程的顺利进行。现此井已淹没，尚存一井栏。其实运木古井的传说，不光玄妙观有，在其它寺观中也有。杭州西湖南屏山下的净慈寺就有一口运木古井，其传说内容和玄妙观大同小异，不过施展法术的是家喻户晓的济公。
运木古井
财神殿
原殿位于东脚门，现移建于此。殿内供奉三位财神：中间的是文财神比干，因其无心从而专司买卖公平，左右是武财神赵公明和关羽。
玄妙观财神殿
文昌殿
建于清乾隆末年。殿堂格局别致，殿内供奉文昌梓潼帝君，两旁奉祀孔子、朱熹。文昌本为星名，民间俗称“文曲星”，为主宰人间功名，禄位之神。苏州文化昌盛，文士众多，文昌崇拜旧时极盛。
玄妙观文昌殿，中为文昌梓潼帝君，两旁为孔子、朱熹
妙一统元”匾
悬挂于三清殿檐下，原由金之俊所书，笔力雄健。但经长时间的日晒雨淋，字体已见陈旧剥蚀，亟需重摹见新。然而匾上“一”字已全无印迹，难以摹写。许多名人为之补写，但效果都不理想。忽然来一农夫自荐，经试笔，果然令人满意。原来，这个农夫每天挑柴进城叫卖，必到三清殿露台小憩，天天看到匾上的大字，日久，字形默记心中，以致一挥而就。