成分 10×连接Buffer
回收的PCR产物(100ng/μl)
T载体(50ng/μl) T4DNA连接酶(6WeissU/μl)
ddH2O 总体积
10 000r/min离心5s混匀。?
用量 1 5 1 1 7.0 15.0
放在调好16℃的保温瓶内,并将保温瓶装盖严,置4℃冰箱冷藏式放置过夜。? 三、试剂?
1.10×T4DNA连接酶缓冲液? 660mmol/L Tris-HCl(pH7.5)? 55mmol/L MgCl2? 50mmol/L DTT? 10mmol/L ATP? 2.无菌水? 3.T4DNA连接酶? 四、说明? 1.连接缓冲液?
现使用的缓冲液多数是随商品连接酶由厂家同时提供的。也可自己配制。常用的缓冲液为Tris-HCl溶液,pH7.5,使用时需加含-SH的化合物如疏基乙醇和二硫苏糖醇,还应有一定浓度的Mg2+及新鲜未降解的ATP。除此之外,还常加入一定量的牛血清白蛋白。为了保证ATP不被降解,每次要用新鲜的,也可直接配制在连接缓冲液中,因为在连接缓冲液中ATP比较稳定。连接缓冲液应在-20℃冰箱中保存,储备液不可反复冻融,最好配制后分装保存。 2.DNA连接酶用量?
T4DNA连接酶的量以Weiss单位度量。1Weiss单位是20分钟37℃催化1nmol[P]焦磷酸转化到[P]ATP的酶量。连接酶用量与DNA片段的性质有关,如果需要连接平齐末端,必须加大酶量,一般用连接粘性末端酶量的10~100倍。连接平齐末端时,还可加入T4RNA连接酶,在T4RNA连接酶存在下,可使平齐末端的连接效率提高数十倍,但对粘性末的连接并无影响。?
3.连接带有粘性末的DNA片段时,DNA浓度一般为2~10μl/ml,连接平齐末端时,需加大DNA浓度至100~200μg/ml(这里浓度的计算以假定DNA片段长度为200~5000bp对为前提)。提高DNA浓度将促进分子间的连接,降低浓度对分子本身环化有利。?
4.连接反应后,反应液可在0℃储存数天,-8℃储存2个月。但是,在-20℃冰冻保存将会
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降低转化效率。?
5.粘性末端形成的氢键在低温下更加稳定。所以,尽管T4DNA连接酶的最适反应温度为37℃,在连接粘性末端时,温度以15~20℃为宜。?
6.5mmol/L ATP将完全抑制T4DNA连接酶连接平齐末端,而181mmol/L ATP才能抑制粘性末端的连接。连接反应液中ATP浓度一般在0.5-1mmol/L范围内。?
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实验五 重组DNA的转化??
一、原理? 1.转化的概念?
外源基因DNA片段与载体组成的重组,需先进入受体细胞,才能进行增殖与表达。以质粒为载体得到的重组体或重组子是重组质粒。把重组质粒DNA转入受体细胞(菌)称为转化。把重组噬菌体或重组病毒DNA引入受体细胞(菌)叫转染。? 2.感受态?
感受态就是细菌吸收周围环境中的DNA分子的生理状态。所以要转化成功,首先要使受体菌处于感受态。刺激细菌使之成为感受态的方法很多,如CaCl2处理、电激等。? 3.DNA转化的过程?
受体菌以Ca2+处理,在低温中与外来DNA分子相混合,DNA分子转化的复杂过程包括4步:
(1)吸附—完整的双链DNA分子汲附在受体菌的表面;?
(2)转化—双链DNA分子解链,单链DNA入受体菌,另一链降解;? (3)自稳—外源质粒DNA分子在细胞内又复制成双链环装DNA;? (4)表达—供体基因随同复制子同时复制并被转录、转译。? 二、方法 ?
(一)受体菌的培养与CaCl2处理?
1.从固体培养基平板上吊菌接种到2mlLB试管中,37℃振荡培养过夜。? 2.取0.4ml菌液转接到30ml/150ml三角烧瓶中,振荡培养2小时30分钟以上,? 3.取9ml菌液于灭菌有盖离心管4000 r/min离心5分钟,收集菌体。?
4.把菌体悬浮在75mmol/L CaCl2中(约10毫升左右),冰浴25分钟,4000r/min离心5分钟,收集菌体。?
5.再把菌体悬浮在0.6毫升的75mmol/L冷CaCl2中,使菌液浓缩15倍(9毫升~0.6毫升),冰上作为转化用的受体菌菌液。? (二)转化反应?
1.在灭菌的1.5ml离心管中加入50μl新鲜制备的DH5α感受态菌及5μl的连接产物,混匀后冰浴30min。
2.将离心管移入42℃水浴中,恰好停留90sec(切忌振荡)。使受体菌极短暂热刺激,以利于DNA的吸收,提高转化效率。
3.立即将离心管置于冰浴中,120sec后再移入37℃水浴中孵育5min。
4.向离心管中加入200μlLB液体培养基,在37℃恒温振荡器上以110r/min培养1h。以利转化后的受体菌,在良好的环境(通气、新鲜的LB液体培养基)中繁殖生长。 (三)涂板?
1?取反应物在平板上涂布。?
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2?涂布菌液的平板置室温下干燥,然后倒置在37℃温箱中培养过夜。? 三、试剂?
75mmol/L CaCl2溶液? 无水氯化钙4.16克? ddH2O 至500毫升? 1.1kg/cm灭菌20min? ?四、材料? 1.菌种? 大肠杆菌 DH5α? 2.培养基? (1)LB液体培养基? LB液体培养基? 精解蛋白胨 3 g? 酵母浸出粉 1.5 g? 氯化钠 3 g? 葡萄糖 0.6 g?
按上述配方用重蒸水(ddH2O或dH2O表示,下同)溶解至300 ml。用10mol/L NaOH调pH至7.2~7.4。分装于15 ml 试管中,每支5ml。然后置高压蒸汽消毒锅以1.1kg/cm灭菌20 min。
(2)LB固体培养基:取500ml三烧瓶,加入? 琼脂 4克? LB液体培养基 200ml? 1.1kg/cm灭菌20分钟? 3.抗菌素? Amp(100mg/ml) 五、仪器? 1.恒温培养箱? 2.恒温振荡器? 3.普通离心机? 六、说明?
1.连接后的DNA溶液与细胞混合后,一定要在冰浴条件下操作。如果温度时高时低,转化率极差。?
2.DNA连接液的盐浓度较高,与细胞混合时要加以稀释,因为高盐浓度会影响转化率。? 3.外源DNA的大小和结构对转化效率有很大影响,一般说来,分子越小,转化效率越高;环形分子的转化效率比线形分子的转化效率要高等于多。共价闭环的超螺旋的质粒DNA比同
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种线形DNA分子的转化效率高上千倍,因此,在转化前要尽量保证重组DNA为完整的环状分子。
4.用于转化的细菌细胞在对数生长期的转化能力最高,静止生长期以后,转化能力逐渐丧失。
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