1956年川大农学院迁雅安独立建校为四川农学院，气象教研室随迁雅安，归属农学系。1984年合系建院，气象教研室、作物栽培教研室等室合并，建立作物栽培学系。2003年1月资环院成立，气象学与生态学组建成气象与生态学系。2004年开始招收生态学专业的本科生，2006年开始招收硕士生。
学科目前有教授1人，副教授3人，讲师5人，硕导师3人，是一个学缘结构比较健康的学科，但受制于发展的传统和水平的低下，不能算是杰出的补充学科。虽学科带头人朱雪梅涉及较广，但基本上没有在一个专业领域取得较具影响力的发言权。
NO.6水产养殖
水产学科一直以来是川农的比较边缘的“主干学科”，虽然川农的水产很不错，但一直处于发展的末端。川农曾一度与郫县的四川省水产学校联合办学，建成川农水产学院，但由于利益纠纷，在合同期结束后不欢而散，四川省水产学校随即与四川水利职业技术学院合并，成为它的一个校区。
水产养殖在2003年被批准为硕士点，目前也只有李志琼一位教师在本领域招收硕士研究生，十分冷清。川农水产养殖的本科交火，这也说明川农水产养殖的教学型特征。在内地来说，川农的水产养殖还是处于比较巅峰的位置，可以视为优势学科。
NO.8技术经济管理
川农的技术经济管理在2001年获批为硕士点，但发展较慢。学科带头人李冬梅人脉较广，这在比较封闭的雅安十分难得，但者并未能给学科带来好处。另一名副高林鸿从西南财大毕业后在川农任职，主要进行统计学方面的研究，但去年女儿毛彦林生病，给她带来了比较大的床上。
技术管理的另外一名带头人郑循刚从农业经济转型而来，曾在广岛大学进修，为四川省学术技术带头人后备人选，研究能力不错，学院为此配备了信息管理与信息系统专业让他担任系主任，但随着信息管理与信息系统本科专业的取消，他可能回回到农业经济的路线上去。至于张劲松，则没有较大的科研水平，仅仅主持过几项省级二流课题。
川农的技术经济学可能永远也不会有大的发展，不说省外，在省内都有一个西南财大的存在，它随时都可以挖走川农的杰出人才。而将技术经济学定位于农业，则立马会失去技术经济学本身的立足之本，成为农业经济学。
NO.8产业经济学
产业经济学是川农在应用经济学方面唯一的硕士点，2006年被批转，学科带头人为杨锦秀，川农的学术骨干，农业经济管理的博士生导师，同样从财大毕业，她在产业经济学方面的研究主要着眼于农业制度与农业政策，但创新水平较低。
另外从一名骨干谭静，水平较低，研究轨迹也比较混乱。之前在图书馆工作，为研究员，主要研究方向为图书馆学，后调任金融系，开始进行农村金融方面的研究，但研究所取得的成果没有实质性的突破。
此外，任大廷也在这个专业招收研究生，但任的水平不高，基本上处于半职状态。院系调整后任大廷调任政法学院担任副院长，这样的情况还会持续。与技术经济管理一样，川农的技术管理很难出现杰出的成成绩，必须跟农业经济管理保持一个比较好的距离才会有真正的发展。
NO.7土地资源管理
土地资源管理是一个比较老的硕士点，1996年被批准为硕士点。学术带头人为张文秀，虽然号称研究农村区域经济，但在做区域经济方面的积累不够，甚至不如农业经济管理方面的肖洪安。农业经济方面的陈文宽也在这个方向招收研究生，但他对社区发展与土地利用的理解甚至不如张文秀透彻。后来从外界引进了冉瑞平，冉是一个典型的研究型学者，对教学不怎么感兴趣，但水平确实很不错。他的代表作《长江上游地区环境与经济协调发展研究》可以算是川农在区域经济学方面的成就最高的。此外，他主持的《秀山县土地利用总体规划》曾经获得国土资源部优秀科研成果一等奖。
土地资源管理的一大问题至今没有理清，本科生在资环院，研究生在经管院。虽然土地资源管理是四川省特色专业，但是发展并不好。经管院希望将本科教学权拿过来，资环院希
望将研究生招收权要过去，成为体制难题。因此，土地资源管理的发展，还带着许多的不确定性。
总体来看，川农的单个硕士点当中，有希望取得较大的发展（譬如在其带动下获得一级学科硕士点甚至是单个学科博士点）的可能性都比较低。食品科学与工程，是川农最有可能短期内能够获得的新增一级学科硕士点。因为在食品科学领域的4个二级学科里，川农已经取得了两个硕士点，并且实力较强（有省级重点实验室），如果再拿下一个，距离一级学科硕士点也就不远了。至于其他门类，基本上希望渺茫。水产虽然二级学科数量较少，但水产捕捞川农基本上没什么可能得到发展。
(13)自设学科：看不见真正的未来
“自我设置”与资源浪费
在川农的博士点、硕士点当中，还活跃着许多“自我设置”的博士点、硕士点——这是因为，依据相关规定，拥有一级学科授予权的单位，可以根据自身需要，自主设置一级学科下的二级学科博士点，硕士点，川农非常有效地利用了这个规定。
在三个一级学科博士点下，川农在作物学下设置了植物资源保护与利用、药用植物学、作物保护、种子科学与技术、生态农业5个博（硕）士点；在畜牧学下设置了动物营养与食品工程、动物与人的比较营养、动物营养与免疫调控、动物生产与环境控制、动物遗传资源保护、畜牧生物工程6个博（硕）士点；在兽医学下设置了4个博（硕）士点。共计15个。
实际上，自己建立博士点、硕士点，可以扩大学科的包容力度和影响力，因为一般来说，设置博士点、硕士点都有一个相对照的本科专业，从而推动这个本科专业的发展。但这也有可能削弱优势学科的根本，因为新设置的博士点师资力量往往不够充分，需要借调师资，这可能会影响已经拥有的学科的稳定。
由于师资缺乏和生源，在作物学领域，作物保护学科在2009年取消招收硕士生和博士生的计划，余下植物资源保护与利用、药用植物学、种子科学与技术和生态农业4个自设点。在畜牧学领域，主要以营养学科的变化较大，动物营养与免疫调控、动物生产与环境控制、动物遗传资源保护、畜牧生物工程4个专业点取消招收博士生和硕士生的资格，余下动物营
养与食品工程和动物与人的比较营养专业维持着招生地位。而兽医学领域则全部取消自设专业的招生名额。那么，我们来看看这些余下的自主设立的博（硕）士点的情况。
植物资源保护与利用的学科主要带头人是李庆和张利。李是农业昆虫与害虫防治学科的带头人，四川省学术和技术带头人后备人选，学科内担负植物驯化方向的导师；张是应用化学专业负责人，同为四川省学术和技术带头人后备人选，学科内担负生物技术的工具化运用方向的导师。其他几名导师和他们一样，都从其他学科借调兼职。
药用植物学科的主要带头人吴卫。学科力量直接从本科中草药栽培与鉴定专业发展而来，吴系中药栽培专业的学科带头人。后西华师范大学的“环境科学与生物多样性保护”省重点实验室副主任黎云祥教授在本专业招收博士生，但交流比较欠缺。川农的中药栽培力量意志薄弱，药用植物学也似乎难有大成。
种子科学与技术的学科主要带头人为佘跃辉。师资力量建立在三所和川农的种子科学与工程本科专业上。川农的种子科学与技术建立的基础比较扎实，因为川农的育种学科一直比较强大，佘跃辉本人就曾师从荣廷昭院士从事玉米的选育工作。但种子科学与技术现有的力量不足以出现比较大的发展。佘近年转型到豆类种质资源的研究，种子科学与技术的发展让新忧虑。
生态农业的学科主要带头人李首成。师资力量建立在本科专业农村区域发展上，但农村区域发展的定位不明确，作为农业经济管理的二级学科，农村区域发展授管理学学位，而生态农业则属于农业的范畴。李守成本人也任雅安市政协副主席，近些年在学术上基本没有建树。吴永成则没什么实力。年轻一代中税伟跑到国外，郑顺林转而重点从事马铃薯育种研究，反而取得了较好的成绩。而生态农业本学科发展十分脆弱，后来渐渐从区域农业规划的方向转入到作物栽培的方向。
动物营养与食品工程的学科带头人是食品科学领域的邬应龙，曾受教于陈一资教授。基本上能够接过陈留下来的事业，水平较高。但食品学院和动科学院之间的行政藩篱阻挠了学科更为深层次的发展，也就没能够真正地取得比较相称的突破。学院藩篱是中国高等教育界的通病，但在川农，似乎有些不可承受之重。
动物与人的比较营养是为适应长江学者雷新根的要求而设置。为了保证长江学者雷新根教授研究的独立性，在成都建立了未来农业与人类健康中心，由雷新根教授独立开展研究。作为长江学者，雷新根教授的创新能力毋庸置疑，但就动物与人的比较营养而言，至今未能出现任何一项有较大价值的科研成绩。
实际上，包括那些取消招生计划的自设点在内，每一个自设点的设置都无一例外地推动了对应本科专业的发展。但是由于水平的不足，基本上没有取得相应的成就。与之相反的是，学校始终保持着对这些自设博士点、硕士点比较高的投入——既然投入量如此之大，而产出量如此之低——我们是否应该反思这样匆忙的自设“博士点”操之过急，资源浪费？
(14)新兴学科：在市场化下的亮光
寻找未来：川农的10个新兴明星学科
新陈代谢，是历史的规律，也是教育的规律。旧有的学科在老去，新兴的学科在崛起，在全国如此，在川农也是如此。实际上，随着社会的发展，川农的一些新兴学科正在崛起，一些原本发展并不受关注的学科也正在走向闪光。
如果我们能够意识到这些新兴学科的出现，并且积极进行相应的支援，那么也许我们能够占领一些新的领域。下面列出川农近些年来涌现的10个发展速度较快，并且具有一定影响力的学科。这种学科不仅仅体现在学术影响力上，也体现在社会、民众等草根影响力上。
我必须首先界定一下农学、林学、动物科学、动物医学、园艺和农业资源与环境这六个个国家级特色专业以及几个升级特色专业，因为特色专业本身就属于传统的强势学科，不应该算在新兴的行列。
1、 政法学院-社会工作
社会工作是一个最近在兴起来的专业，川农的社会工作，原本起点较低。但川农的社会工作定位比较准备，在赵晓霞和范召全务实作风的带领下，川农的社工取得了较大的发展。社会师资力量比较年轻，但基本上都是从自于武大、人大、中青政等传统社工强校中招徕的