质粒纯化
1)质粒酶切后加入200 ul ddH2O,然后加入100 ul 酚/氯仿,剧烈震荡混匀; 2) 4℃, 12000 rpm, 15 min;
3)转移上清至一新EP管中,加入1/10体积的3 M NaAC和2倍体积的无水乙醇,充分混匀(直接从大抽质粒纯化时,100 ul质粒(不够,ddH2O补齐)+30 ul 3 M NaAC + 200 ul无水乙醇); 4) 4℃, 12000 rpm, 10 min;
5)用预冷的75%乙醇洗3次(4℃, 12000 rpm, 5 min每次);
6)用75%乙醇装满,拿进细胞房,倒掉乙醇,风干5-6 min(不超过10 min,否则难溶);
7)加入20-40 ul 1xTE buffer(已过滤除菌)充分溶解; 8)测浓度,分装,-20℃保存。
细胞DNA抽提
1) 吸弃去培养液,用PBS洗两次(6孔板中);
2) 加1 ml细胞裂解液、40 ul 20 mg/ml的蛋白酶K、10ul的10mg/ml的RNaseA,
用封口膜封好,再用保鲜膜包好后,55℃烘箱过夜;
3) 2 ml异丙醇沉淀DNA,摇匀后,用枪将DNA 挑起放入新的1.5 ml EP管中; 4) 75%酒精沉淀两次,12000 rpm,5min,再用100%的酒精洗一次; 5) 晾干后,加入1xTE 100 ul 溶解过夜。
鼠尾中DNA的提取
1) 在含有约0.5 cm 小鼠尾巴的EP管中加入600 ul 50 mM的NaOH; 2) 在金水浴中90-100℃煮1 h;
3) 加入50 ul pH 8.0的Tris/HCl后,颠倒混匀; 4) 12000 rpm,20 min;
5) 取上清500 ul于另一做好标记的管中。
Real-time PCR
1. SYBR检测方法:
(请注意2.5xRealMasterMix和20xSYBR solution避光保存) 1) 20xSYBR solution在室温下平衡并彻底混匀。
2) 将125 ul 20xSYBR solution 加入至1.0 ml 2.5x RealMasterMix中。
(加入20xSYBR solution的2.5xRealMasterMix溶液在-20℃可以保存三个月。在使用前务必彻底混匀RealMasterMix/SYBR solution。如果解冻后并没有使用,一定要注意在再次冷冻前彻底混匀。 反应体系
组成成分 50 ul体系 25 ul体系 11.25 ul 20 ul体系 9 ul 终浓度 1x 2.5xRealMasterMix 22.5 ul /20xSYBR solution 正向引物 反向引物 DNA模板 超纯水
2.PCR检测 反应步骤(建议) 循环 1x 步骤 1 2 35-45x 3 4 至50 ul 至25 ul 至20 ul 100-300nM 100-300nM -ng-pg 温度 94-95℃ 94-95℃ 50-60℃ 68℃ 时间 1-2min 10-20s 10-30s 10-60s 内容 起始模板变性 PCR循环中模板变性 退火 延伸 (解链时间的长短与模板的长度和GC含量有关)
2. 引物稀释:
引物总浓度为1 ?M,体积:200 ?l
ddH2O Primer 1 (20 uM) Primer 2 (20 uM) Total
3. SYBR mixture与template的混合:
SYBR mixture DNA template Total
4. 操作流程:
1)加人10 ul 稀释好的primer至管底
2)加入10 ul SYBR mixture与template的混合物 3)Vortex and Spin down 4)放入仪器检测
5. PCR程序 95℃ 2 min 95℃ 15 s 60℃ 30 s 68℃ 30 s 95℃ 15 s 60℃ 1 min 95℃ 15 s 60℃ 15s **68℃收集荧光
6. 仪器的使用
溶解曲线 40x
40x
9 ul 1 ul 10 ul 180 ul 10 ul 10 ul 200 ul