血管内皮生长因子基因多态性与急性心肌梗死的相关性研究(7)

2019-06-05 14:55

根据个体吸烟状况分层分析发现,与T/T基因型相比,携带C等位基因的基因型(T/C+C/C),明显增加不吸烟个体急性心肌梗死的发病风险,经性别、年龄校正后的OR=2.457,95%Cl=1.357一4.45。根据急性心肌梗死病理类型进行分层分析发现,与T/T基因型相比,携带C等位基因的基因型(T/C+C/C),明显增加肺鳞状细胞癌及小细胞癌的发病风险,经性别、年龄及吸烟状况校正后的OR分别是1.867和2.092,95%CI分别是1.058-3.295和1.036-4.224。 2.2 VEGF-1154G/A单核普酸多态性分布与急性心肌梗死发病风险相关性分析

健康对照组中的VEGF-1154G/A单核营酸多态性的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),可以认为其具有良好群体代表性。急性心肌梗死患者组VEGF-1154G/A SNP G和A等位基因频率分别为77.8%、22.2%;在健康对照组中分别为73.0%、27.0%;急性心肌梗死患者组的A/A、G/A和G/G基因型频率分别为4.0%、36.5%、59.5%;健康对照组的A/A、G/A和G/G基因型频率分别为5.4%、43.1%和51.5%。由于A/A基因型频率较低,遂将G/A与A/A基因型合并,合并后急性心肌梗死患者组的G/G、G/A+A/A基因型频率分别为59.5%、40.5%;健康对照组基因型频率分别为51.5%、48.5%。VEGF- 1154G/A的等位基因和基因型频率分布在急性心肌梗死患者组和健康对照组之间无统计学意义(P>0.05)。与G/G基因型相比,携带A等位基因的基因型(G/A+A/A)与急性心肌梗死的发病风险无明显相关性,经性别!年龄及吸烟状况校正后的OR=0.738,95% Cl=0.494-1.103。

根据个体吸烟状况分层分析发现,与G/G基因型相比,携带A等位基因的基因型(G/A十A/A),可降低不吸烟个体急性心肌梗死的发病风险,经性别、年龄校正后的OR=0.412,95% Cl=0.228-0.746。根据急性心肌梗死病理类型进行分层分析,未发现VEGF-1154G/A多态性与急性心肌梗死发病风险的相关性。应用2LD软件对VEGF- 1154G/A与VEGF- 460T/C多态性位点进行联合分析显示:两多态性位点间不存在连锁不平衡(D,=0.370936)。 3 VEGF基因SNP位点等位基因频率的组间比较

对两组之间VEGF基因SNP位点各等位基因频率进行卡方检验,发现VEGF基因+405、+936等位基因频率在两组间有显著性差异(分别为P=0.000,P=0.002,

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<0.05);而-460、-2578等位基因频率在两组间无显著性差异(分别为P=0.990,P=0.429,<0.05),见表。

表 5 VEGF基因各SNP位点等位基因—率的2组间比较

Table 5 Comparisons of VEGF SNP allele frequencies among the two groups

SNP位点 +405 -460 +936 -2578

等位基因 G C T C C T A C

研究组 72(60.8) 76(39.2) 116(78.4) 32(21.6) 121(81.8) 27(18.2) 37(25.0) 111(75.0)

对照组 100(58.8) 70(41.2) 134(78.8) 36(21.2) 147(86.5) 23(13.5) 40(23.5) 130(76.5)

χ2 18.360 0.021 12.875 0.429

P值 0.000 0.990 0.002 0.980

为明确VEGF基因+405、+936等位基因频率在两组之间的差异是否有统计学意义,再采用卡方检验进行组间两两比较。此时通过Bonfemmi校正法进行多重检验校正,校正后的检验水准为a=0.017(a/3),即P< 0.017时具有统计学差异。两两比较发现,+405等位基因频率在重症组与对照组比较、重症组与轻症组比较,有显著性差异(分别为P=0.000,P=0.015, <0.017) , C等位基因在重症ROP的比例明显高于对照组与轻症组;而轻症组与对照组无显著性差异(P=0.069, >0.017)。重症组与对照组间,相对于G等位基因,携带C等位基因发生重症ROP的风险度为2.711(OR:2.711,95%CI: 1.709-4.302);重症组与轻症组间,相对于G等位基因,携带C等位基因发生重症ROP风险度为1.798(OR: 1.798,95%CI: 1.121-2.885)。+936等位基因频率在重症组与对照组比较有显著性差异(P=0.001,<0.017) , T等位基因在重症ROP的比例明显高于对照组。相对于C等位基因,携带T等位基因发生重症ROP的风险度为2.684(OR:2.684,95%CI:1.521-4.739);在重症组与轻症组间、轻症组与对照组间均无显著性差异(分别为P=0.6l3,P=e.249, >0.017)。 2.3 PEDF基因SNP位点基因型及等位基因频率的组间比较 2.3.1

PEDF基因SNP位点的HWE检验

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对PEDF基因两个SNP位点在对照组、轻症组和重症组间的基因型频率分布进行HWE检验,结果显示中两个位点在3组间的基因型分布频率符合HWE (P>0.05),说明人群具有代表性,见表2-6。 2.3.2

PEDF基因SNP位点基因型的组间比较

对两组之间PEDF基因两个位点基因型频率进行卡方检验,发现PEDF基因-5376基因型频率在两组间有显著性差异(P=0.003,<0.05),而+311基因型频率在两组之间分布无显著差异(P=0.182,>0.05)。见表。

表 6 PEDF基因SNP位点基因型频率2组间比较 Table 6 Genetype frequency of PEDF SNP among the three groups

SNP位点 -5376 +311

基因型 CC CT TT HWE-P TT CT CC HWE-P

研究组 13(17.6) 35(47.3) 26(25.6) 0.83 8(10.8) 23(31.1) 43(58.1) 0.09

对照組 14(16.5) 48(56.5) 23(27.0) 0.18 12(14.1) 31(36.5) 42(49.4) 0.12

χ2值 16.408 6.233

P值 0.003 0.182

为明确两组之间的差异是否有统计学意义,再采用卡方检验对PEDF基因-5376基因型频率进行组间两两比较,此时通过Bonfeironi校正法进行多重检验校正,校正后的检验水准为α=0.017(a/3),即P<0.017时具有统计学差异。发现重症组与对照组之间有显著差异(χ2=l5.222,P=0.000,<0.017);而轻症组与对照组间(χ2=1.503,P=0.472,>0.017)、重症组与轻症组(χ2=7.455,P=0.24,>0.017)基因型频率分布无显著性差异。

3 PEDF基因各SNP位点等位基因频率的组间比较

对两组之间PEDF等位基因频率进行卡方检验,发现PEDF基因-5376等位基因频率在两组间有显著性差异(P=0.003,<0.05),而+311等位基因频率组间无显著差异(P=0.383,>0.05),见表。

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表 7 PEDF基因SNP位点等位基因频率的2组间比较

Table 7 Comparisons of PEDF SNP allele frequencies among the two groups 10.5 -5376 +311

等位基因 C T T C

研究组 61(41.2) 87(58.8) 39(26.4) 109(73.6)

对照组 76(44.7) 94(55.2) 55(32.4) 115(67.6)

χ2 11.503 1.919

P值 0.003 0.383

为明确PEDF-5376等位基因频率在两组之间的差异是否有统计学意义,再采用卡方检验进行组间两两比较。此时通过Bonferroni校正法进行多重检验校正,校正后的检验水准为a=0.017(a/3),即P< 0.017时具有统计学差异。两两比较发现,PEDF基因-5376等位基因频率在重症组与对照组比较、重症组与轻症组比较有显著性差异(分别为P=0.001, P=0.009, <0.017),T等位基因在重症ROP的比例明显高于对照组与轻症组;而轻症组与对照组无显著性差异(P=0.531,>0.017)。重症组与对照组间,相对于C等位基因,携带T等位基因发生重症ROP的风险度为2.213(OR:2.213,95%CI: 1.371-3.572);重症组与轻症组间,相对于C等位基因,携带T等位基因发生重症ROP的风险度为1.919(OR:1.919,95% CI:1.170-2.883.1485)。见表8。

表 8 PEDF基因-5376等位基因频率组间两两比较

Table 8 Comparisons of PEDF -5376 SNP allele frequencies between the two

groups

χ2 P值 OR (95% CI)

PEDF -5376 C/T研究组vs对照组 0.393 0.531 1.153 (0.739-1.800)

eNOS基因SNP位点基因型及等位频率的组间比较2.3.1 eNOS基因SNP位点的HWE检验对eNOS基因两个SNP位点在对照组、轻症组和重症组间的基因型频率分布进行HWE检验,结果显示两个位点基因型分布频率符合HWE (P>0.05),说明人群具有代表性,见表9。

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eNOS基因SNP位点基因型的组间比较对两组之间eNOS基因两个SNP位点基因型分布频率进行卡方检验,发现eNOS基因-786、+894基因型频率在两组间无显著性差异(分别为P=0.590,P=0.834, >0.05),见表9。

表 9 eNOS基因SNP位点基因型频率2组间比较

Table 9 Comparisons of eNOS SNP genotype frequencies among the two groups

SNP位点 -786 +894

基因型 CC CT TT HWE-P TT GT GG HWE-P

研究组n(%) 3(4.1) 17(23.0) 54(72.9) 0.28 4(5.4) 17(23.0) 53(71.6) 0.11

对照组n(%) 4(4.7) 23(27.1) 58(68.2) 0.39 7(8.2) 24(28.2) 54(63.5) 0.09

χ2 2.812 1.458

P值 0.590 0.834

4 eNOS基因SNP位点等位基因频率的组间比较

对两组之间eNOS基因两个位点等位基因频率进行卡方检验,未发现显著差异(分别为P=0.231,P=0.410,>0.05),见表10。

表 10 eNOS基因SNP位点等位基因频率2组间比较

Table 10 Comparisons of eNOS SNP allele frequencies among the two groups

SNP位点 等位基因 研究组 -786 +894

C T T G

23(15.5)

对照组 31(18.2)

χ2 2.929

P值 0231 0.410

125(84.5) 139(81.8) 25(16.9)

38(22.4)

1.782

124(83.1) 132(77.6)

IGF-1R基因SNP位点基因型及等位基因频率的组间比较 4.1 IGF-1R基因SNP位点的HWE检验

对IGF-1R基因+3174基因型频率在对照组、轻症组和重症组3组间的分布进行HWE检验,结果显示基因型分布频率符合HWE (P>0.05),说明人群具有代表性。

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