基因工程(跨课程)综合性实验讲义 - 图文(9)

2019-08-31 12:26

基因工程(跨课程)综合性实验

样品,称重,用无菌牙签挑取约牙签粗头大小,编号,溶于40ul1×SDS上样缓冲液中备用。

8、将包涵体按5%(W/V)的稀释度重新悬浮于包涵体洗涤缓冲液III,充分混匀,按1ml/管的装量将包涵体悬浮液分配至1.5ml EP管,-20冻存。

9、每个小组取包涵体样品1支,室温解冻,4℃,10000rpm,离心10min,弃上清,加入1ml包涵体裂解缓冲液,充分混匀,37℃保温3小时。4℃,10000rpm,离心10min(上清留样20ul,编号,加20ul2×SDS上样缓冲液;沉淀用无菌牙签挑取牙签粗头大小,编号,溶于40ul1×SDS上样缓冲液中备用)。 10、上清移至10ml试管,用缓慢滴加包涵体复性缓冲液至尿素终浓度为2M(稀释4倍),4℃过夜。

11、取100ul复性液于EP管,4℃,12000rpm,离心10min,上清取样20ul,编号,加20ul2×SDS上样缓冲液;沉淀加40ul1×SDS上样缓冲液,编号。 12、将上述1-7号样品进行SDS-PAGE分析(方法参照附件一)。

七、注意事项

1、使用超声波时应控制强度在一定的限度,即刚好低于溶液产生泡沫的水平。产生泡沫会导致蛋白质变性。

2、在复性蛋白时,要注意一定要缓慢加入包涵体复性缓冲液,以防止变化太快造成蛋白质聚集析出。

八、思考题

1、如何分离包涵体? 2、蛋白质复性的方法有哪些?

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附录一、SDS-PAGE电泳

一、实验试剂

1、2×SDS上样缓冲液:0.1mol/LTris(pH6.8)、4%SDS、20%甘油、0. 2%溴酚篮、200mmol/L DTT(或4%β-巯基乙醇),4℃保存。 2、10%APS,TEMED和DTT存放在4℃冰箱。

3、10×电泳缓冲液:Tris 6g、glycine 28.8g、SDS 10g,pH调至8.3,定容至1L。 4、30%胶母液(Acr-Bis):30%acrylamide、0.8%bis(即acrylamide 30g、bis 0.8g 定容至100ml),可在4℃存放数月。 5、分离胶缓冲液(pH8.8):1.5M Trsi-HCl。 6、浓缩胶缓冲液(pH6.8):1.0M Trsi-HCl。 7、10%SDS

8、考马斯亮篮染色液:1.25g考马斯亮篮R250、450ml甲醇:水(1:1)、50ml冰醋酸

9、脱色液:450ml甲醇:水(1:1)、50ml冰醋酸

二、实验方法

1、配制适量的12%的分离胶,以10ml为例:

H2O 3.3ml、30%胶母液 4.0ml、分离胶缓冲液(pH8.8)2.5ml、10%SDS 0.1ml、10%APS 0.1ml、TEMED 0.004ml。

2、将配制好的分离胶加入制胶槽中,注意应沿着边缘缓慢加入,千万别进气泡。凝胶液加至约距前玻璃板顶端1.5cm或距梳子齿约0.5cm处。

3、轻轻在分离胶溶液上覆盖一层双蒸水(或异丙醇)封胶,使凝胶表面变的平整,静止30min-1h,使凝胶聚合。凝胶聚合后,在分离胶和水层之间将会出现一个清晰的界面,可以微微倾斜模具,检测凝胶是否聚合。 4、除去上面的水层,再用滤纸吸尽残留的液体。 5、配制5%的浓缩胶,以5ml为例:

H2O 3.4ml、30%胶母液 0.83ml、浓缩胶缓冲液(pH6.8)0.63ml、10%SDS 0.05ml、10%APS 0.05ml、TEMED 0.005ml。

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6、迅速将配好的浓缩胶添加到分离胶上面,并将梳子插入凝胶内,至梳子齿的底部与前玻璃板的顶端平齐,小心避免混入气泡。将凝胶垂直放置于室温下,约30min凝胶聚合。

7、将胶板放入电泳槽 中,在上下电泳槽中添加1×电泳缓冲液,使凝胶的上下端均能浸泡在缓冲液中。轻轻拔出梳子,注意不要将加样孔撕破。

8、在电泳槽的泳道中分别添加蛋白Marker和样品20ul。加样时用微量移液器将样品加入样品孔的底部,避免带入气泡。

9、接通电源,上槽(加样孔端)接负极,下操接正极,恒流,起始电流20mA,待溴酚篮前沿进入分离胶,电流增加至30mA。

10、电泳大致需要1-3h(取决于凝胶孔径,特别是缓冲系统和电参数的选择)。待溴酚篮前沿到达电泳槽底部时,切断电源,从电极上拔掉电极插头,取出玻璃板。

11、带上手套,小心移去两玻璃之间的隔片,利用专用的铲子轻轻撬开玻璃板,小心从制胶板上将凝胶剥下,弃去浓缩胶。在右下角切去小片作为定位标记。 12、用清水洗胶,将分离胶放入染色液中缓慢摇动,染色20-30min,小心不要将胶撕破。由于SDS和蛋白质分子竞争染料而干扰考马斯亮篮染色,所以SDS凝胶的染色时间应比常规聚丙烯酰胺的时间要长,或用多倍体积的染色液,以排除SDS的影响。

13、从染色液中将凝胶取出用水漂洗后,将胶放入脱色液中进行扩散脱色,直到背景蓝色褪淡,见到条带,根据具体情况,大约换2-4次脱色液即可。

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六 重组DNA药物

基因治疗是外源正常基因导入靶细胞,以纠正或补偿因基因缺陷和异常引起的疾病,以达到治疗目的。随着DNA重组技术和转基因方法的不断完善,基因治疗研究发展迅猛,在某些疾病的治疗中取得了令人鼓舞的疗效。而用于基因治疗的DNA,分子量较大、带大量负电荷,这就使DNA的体内传递存在困难:分子尺寸较大,很难通过被动扩散进入细胞;所带的负电荷与细胞表面的负电荷相排斥,而易与带正电荷的血浆蛋白结合;另外DNA起作用的部位是细胞核,生物体内的核酶能够将细胞核外的游离DNA降解。说明DNA的传递需要载体的协助,不但要求能够突破进入细胞的重重障碍,还要求能够进入细胞核。因此,人们愈来愈认识到选择合适的载体,使目的基因安全、靶向、可控并有效表达,是基因治疗成功的关键。目前临床试验中所用的载体一般有两类:病毒载体和非病毒载体。虽然目前使用最多的仍然是病毒型载体,占所用载体总量的75%左右,其转染效率可达90%以上,但病毒载体存在潜在的安全性问题,如能诱导宿主免疫反应及潜在的致癌性,同时它制备复杂,所能装载的外源DNA大小有限,使其应用受到很大限制。尤其是1999年出现首例使用腺病毒载体进行基因治疗导致病人死亡事件发生后,关于病毒载体的安全性问题更是成为研究者关心的重点,于是,人们更加关注非病毒型载体的研究。非病毒载体具有低毒安全的特点且适合特殊治疗目的,它们能够携带大量DNA分子,容易大批量生产,费用低廉,对于非病毒基因载体的研究目前主要有:裸露的DNA;阳离子脂质体;阳离子聚合物等。

本综合实验以质粒pCDNA3.1-TCRVβ7.1为例,介绍质粒DNA大规模制备、阳离子脂质体与质粒DNA复合物制备、T细胞体外转染、转染T细胞目的基因表达和体外活性检测、体内给药试验等。

背景知识

1、重组DNA技术

重组DNA技术属于遗传工程分子水平的遗传操作,是一种按照人的意志定

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向改变生物遗传性状的技术。是在体外重新组合DNA分子(脱氧核糖核酸),并使其在适当的细胞中增殖的遗传操作,这种操作可将特定的基因组合到载体上,并使其在受体细胞中增殖和表达。重组DNA技术基本过程:

a、用人工方法取得或合成目的基因

基因是含特定遗传信息的核苷酸序列,是遗传物质的最小功能单位,基因可被分离出来 。基因的合成主要有化学合成和酶促合成两种方法。

b、运载体的选择

运载体的作用是将分离或合成的基因导入细胞或能转移染色体上的DNA片段,所以它必须能自由出入细胞,常用的运载体有SV40病毒,温和噬菌体和质粒等,但最常用的是质粒。质粒是染色体以外能够自主复制的遗传单元,是由双链DNA分子组成,呈环状结构。它可以游离于细胞浆中,也可与染色体整合在一起,它没有蛋白质外套,是裸露的DNA分子,它比染色体小,只带数个或数10个基因,最大的也只有大约100个基因,它上面有一个位点称为原点,可以携带染色体转移。

c、质粒的分离与重组DNA

用溶菌酶裂解菌细胞分离出质粒。用内切酶处理质粒,使它的DNA在一定位置上断裂,并在断裂口出现粘性末端。用同样的内切酶处理分离出的目的基因的DNA,使之具有相同的粘性末端与质粒粘性末端相连接,形成重组DNA稳定结构。将重组DNA导入不含质粒的细菌,即受体细菌中,例如大肠杆菌(F )中,目的基因能随质粒复制而复制,并随细菌的分裂而扩增,形成这一基因的无性繁殖系一重组DNA克隆化。

2、阳离子脂质体

阳离子脂质体作为基因治疗的载体是目前研究的热点之一,其转染率比pH 敏感脂质体高3~150 倍。选用材料多为二油酰基磷脂酰乙醇胺(DEOP) ,阳离子表面活性剂有溴化十六烷基三甲基铵( CTAB) ,溴化双十二烷基二甲基铵(DDAB12) ,溴化双十八烷基二甲基铵(DDAB18),氯化N-(1-(2 ,3-双油酸基) 丙基-N ,N ,N 三甲基铵等。所有的阳离子脂质体都带有一个疏水基团,该基团一般是一至两个脂肪酸或是长约12-18个碳原子的烷基单元或是一个胆固醇单元。疏

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