拟南芥Ferrodoxin基因与甜菜曲顶病毒(BCTV)作用机制研究(3)

2019-01-19 10:45

姜威中山大学硕士论文拟南芥Ferrodoxin基因与甜菜曲顶病毒(BCTV)作用机制的研究称为siRNA(short的RNAi反应。interferenceRNA)(BernsteinE.eta1.2001),它启动了细胞内双链RNA进入细胞后,一方面在Dicer酶的作用下被裂解成siRNA,另一方面在RdRP的作用下自身扩增后,再被Dicer酶裂解成siRNA。SiRNA的双链解开变成单链,并和某些蛋白形成复合物,Argonaute2是目前唯一己知的参与复合物形成的蛋白(Hammond,S.eta1.2001)。此复合物同与siRNA互补的mRNA结合,一方面使mRNA被RNA酶裂解,另一方面以SiRNA作为引物,以mRNA为模板,在RdRP作用下合成出mRNA的互补链(SijenT.eta1.200l;LipardiC.eta1.2001)。结果mRNA也变成了双链RNA,它在Dicer酶的作用下也被裂解成siRNA。这些新生成的siRNA也具有诱发RNAi的作用,通过这个聚合酶链式反应,细胞内的siRNA大大增加,显著增加了对基因表达的抑制。从2l到23个核苷酸的siRNA到几百个核苷酸的双链RNA都能诱发RNAi,但长的双链RNA阻断基因表达的效果明显强于短的双链RNA。在小鼠的胚胎细胞中也存在RNAi,将727个碱基对的双链RNA转入小鼠的畸胎瘤细胞,诱发了细胞内的RNAi机制,并抑制了报告基因的表达(Billy2001)。E.eta1.根据一条mRNA的不同靶位点可以合成出许多条双链RNA,研究发现这些双链RNA的作用差别很大(HolenT.eta1.2002)。GC含量低的区域似乎双链RNA的效果好。线虫内的siRNA可以作为引物,以靶mRNA为模板,在RDRP及Dicer的作用下,大量扩增siRNA。将siRNA的3’末端标记上FITC使它丧失引物的作用,在将其转入哺乳动物细胞内,它抑制靶基因的作用并没有受到影响。因而研究者推测,哺乳动物细胞内不存在象线虫那样的依赖于RDRP的RNAi放大机制。在哺乳动物细胞中瞬时转染dsRNA后,dsRNA的作用只维持了三天。而将表达dsRNA的载体转入哺乳动物细胞后筛选出的稳定表达株中,在转染八周后dsRNA仍能有效的抑制靶基因的表达(Brummelkamp.T.R.eta1.2002)。利用载体表达山的dsRNA为发夹结构,其环状部位的核苷酸的序列和数目对dsRNA的作用都有影响,研究者发现9个核苷酸比5个或7个核苷酸的效果好。dsRNA的作用很强,在lnM时就能有效的阻断靶基因的表达。RNAi还具有很高的特异性。19个核苷6姜威中山大学硕士论文拟南芥Ferrodoxin基因与甜菜曲顶病毒(BCTV)作用机制的研究酸的dsRNA几乎可以完全抑制基因的表达,而将其中的一个核苷酸突变掉后,它对基因的抑制作用就消失了(SuiGH.eta1.2002),这对dsRNA的应用是非常重要的,这可以避免dsRNA降解与靶mRNA同家族的其他的mRNA。双链RNA只能短暂抑制哺乳动物细胞的基因表达。而具有发卡结构的双链RNA能够增加阻断基因表达的时间。在小鼠畸胎瘤细胞,胚胎干细胞,C2C12细胞中,用长链具有发卡结构的双链RNA有效的阻断了报告基因的表达,在稳定表达具有发卡结构的双链RNA的细胞株中,报告基因的表达被长期的阻断了(PaddisonPJ.Eta1.2002)。7姜威中山大学硕士论文拟南芥Ferrodoxin基因与甜菜曲顶病毒(BCTV)作用机制的研究1.2本研究的目的内容和技术方案双生病毒侵染范围广泛,严重影响植物的正常生长,对农业生产造成巨大的危害。甜菜曲顶病毒是双生病毒的一种。研究双生病毒的复制和植物细胞的关系有助于揭示寄主植物与病毒相互作用方式,进而为防治由双生病毒引起的植物病害奠定基础。本论文的研究内容:利用酵母双杂交系统确定和甜菜曲顶病毒(BCTV)中C2蛋白发生相互作用的三个蛋白:Ferrodoxin,AP2,SAMDC设计合适的引物,应用PCR技术扩增Ferrodoxin基因构建pGADGH—Ferrodoxin表达载体构建pGADGH.Ferrodoxin—N。pGADGH—Ferrodoxin—C表达载体构建pBA002一Ferddoxin表达载体构建pSKINT.sense.antisense载体构建pER8一FerrodixnRNAi表达载体构建pGBKT7一C2一N,pGBKT7一C2一C表达载体用农杆菌介导法转化pBA002.Ferridoxin表达载体和pER8一FerrodoxiRNAi表达载体进入拟南芥10.在抗性平板上筛选转基因植物11.Northernblot检测Ferrodoxin在高表达拟南芥中的表达量12.转基因植物的表型分析13.甜菜眭珏顶病毒感染高表达转基因拟南芥14.酵母表达载体共转化酵母,确定蛋白发生作用的结构域8姜威中山大学硕士论文拟南芥Ferrodoxin基因与甜菜曲顶病毒(BCTV)作用机制的研究本实验技术路线图.1:9姜威中山大学硕士论文拟南芥Ferrodoxin基因与甜菜曲顶病毒(BCTV)作用机制的研究本实验技术路线图.2:10


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