分子生药学
指一个物种可以通过逐渐积累变异的方式，经历悠久的地质年代，由一系列的中间类型，过渡到新的种。
（2）分化式物种形成
指一个物种的两个或两个以上的居群由于地理隔离或生态隔离，而逐渐分化成两个或两个以上的新种。
需要经过亚种的阶段，如地理亚种或生态亚种，然后才变成不同的新种。
异域式物种形成
祖先种的原始分布区是连续的，如果由于不可抗拒的外界原因，原有分布区被分割成数块，相互间距，不允许花粉和种子(繁殖体)传送。 （1）被隔离的种群虽有越来越明显的差别，但终究没有超出种的界限，若有机会相遇仍可正常杂交，没有产生新种。 （2）被隔离的种群隔离时间长，分化趋向不同，积累到一定程度便产生彼此不能正常杂交的效果，成为亲缘关系很近的不同种。 同域式物种形成 在非地理隔离状态下，多倍体的出现可以导致新种就地形成。 约70%的被子植物进化史上都曾经历过多倍化，多倍体的形成使植物产生了形态上的分化，并使植物有可能获得新的基因亦或是新的生理学性状，这些改变可以使得多倍体植物的竞争能力或是生态耐受性较二倍体祖先所加强。
新的适应性以及染色体结构的变化而可能形成的生殖隔离，使它们和原有类型日趋岐化，最后导致新种的问世。
并非所有经历过多倍化的种类都表现多倍体特征，常表现二倍体特征。
因为在多倍化事件之后，常常伴随有一个广泛的、迅速的二倍化过程，赋予多倍体基因组新的细胞遗传学特性，使之在核型特征以及基因表达水平和式样等方面表现与二倍体相似的特点。
同域式物种形成的机制-三倍体桥理论
一个未减数的配子与一个经过正常减数分裂的配子融合而形成三倍体（2n+n=3n），产生的三倍体由于不能正常进行减数分裂，有可能产生未减数的配子，当其与进行正常减数分裂的二倍体回交时，则形成了四倍体合子(3n+n=4n)。
2．爆发式物种形成
爆发式物种形成是指不需要悠久的演变历史，在较短时间内形成新物种的方式。 这种形式一般不通过亚种阶段，而是通过染色体数目或结构的变异、远缘杂交、大的基因突变等，在自然选择的作用下形成新物种。
就是指对生物多样性和生物演化历史进行研究的学科。
就是对不同的植物进行描述、命名和分类，在此基础上对其自然演化关系进行研究的学科。它包括：
（1）分类系统的研究。
命名和分类，在此基础上对其自然演化关系进行研究的学科。
药用植物分子系统研究是植物分子系统研究的重要组成部分，研究对象是药用植物丰富的类群；通常以属、种为主。
蕨类植物门：石松科：