华东理工大学药学院
蛋白质的一级结构（Primary Structure）包括：(1) 组成蛋白质的多肽链数目；(2) 多肽链的氨基酸的排列顺序；(3) 多肽链内或链间二硫键的数目和位置。其中最重要的是多肽链的氨基酸顺序，它是蛋白质生物功能的基础。自从1953年F. Sanger测定了胰岛素的一级结构以来，现在已经有成千上万种不同蛋白质的一级结构序列被测定。
蛋白质的二级结构
蛋白质的二级（Secondary Structure）结构是蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构，也就是该段肽链骨架原子之间的相对空间构象，并不涉及氨基酸残基侧链的构象。α-螺旋（helix）、β-折叠（sheet）是蛋白质二级结构的主要形式，此外还有转角（turn）、卷曲（coil）等形式（参见图5）。
图5、蛋白质二级结构和三级结构示意图（蓝色为N末端，红色为C末端）。
蛋白质的三级结构
是指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置，也就是整条肽链所有原子在三维空间的排布位置（即主链和侧链的所有原子的空间排布，参见图5）。一般非极性侧链埋在分子内部，形成疏水核，极性侧链在分子表面。
蛋白质的四级结构
对于二、三级结构而言,只涉及到由一条多肽链卷曲而成的蛋白质，在体内有许多蛋白质分子含有二条或多条肽链。每一条肽链都有完整的三级结构，称为蛋白质的亚基。亚基与亚基之间呈特定的三维空间排布，并以非共价键相连接，这种蛋白质分子中各个亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用，称为蛋白质的四级结构。各个亚基间的结合力主要是疏水作用，氢键和离子键也参与维持四级结构。